肺癌中肿瘤抑制基因ceacam1的选择性拼接与ptb的过表达有关论文

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1、肺癌中肿瘤抑制基因CEACAM1的选择性拼接与PTB的过表达有关论文【关键词】肺癌AlternatingSplicingofTumorSuppressorGeneCEACAM1isCorrelatedail:yldseu.edu.Abstract:ObjectiveThepossibilityofmodulatingthedifferenceofCEACAM1splicingpatternbetortissuesandtheircorrespondingnonmalignantlungtissue.MethodsDetecttheexpressionpatternofCEACAM1inn

2、onsmallcelllungcancer(NSCLC)byHotPCR,minigeneconstructsandcotransfectionthisminigenecouldbesplicedinacellspecificmanner.Theexon7inantlyincludedinH1944,butpredominantlyexcludedin22B.OverexpressionofPTBcouldubiquitouslyaltertheratioofCEACAM1LandCEACAM1S.TheamountofCEACAM1Lanner.Conclusion1exo

3、n7.Aclearcorrelationerase购自Qiagen公司。1.2方法1.2.1细胞培养H1944、22B由美国M.D.安得森癌症中心毛力先生惠赠。细胞在37°C、5%CO2、DMEM/F12培养基(5%的小牛血清,100U/ml青霉素和100μg/ml链霉素)中生长。1.2.2RT“Hot”PCRRT“Hot”PCR用末端标记32P的引物进行,上游引物:5’GGTTGCTCTGATAGCAGTAG3’,下游引物:5’AGCCTGGAGATGCCTATTAG3’,来扩增细胞中CEACAM1两种表达产物,分别为CEACAM1L(408bp)和CEACAM1S(35

4、5bp)。PCR反应体系为12.5μl,含7%DMSO,1.5mMdNTP,6.7mMMgCl2,16.6mM(NH4)2SO4,67mMTris,10mMβ巯基乙醇,6.7mMEDTA,1.2mM引物,0.625U的Hotstar聚合酶。反应条件如下:95℃变性30s,60℃退火1min,70℃延伸1min,25个循环,PCR产物行6%聚丙烯凝胶电泳,压X光片。1.2.31迷你基因重组质粒的构建用PCR方法获得CEACAM1基因中从内含子5至外显子8长1606bpDNA片段插入到真核表达载体pCMV中,重组质粒经测序鉴定。引物序列为:5’GGGAATTCCCATGACAaATAAT

5、GCTCTACC3’和5’GGTACCCTTGTTAGGTGGGTCATTGG3’。为了避免内含子5和外显子6的连接处拼接位点核苷酸序列可能的影响,我们将内含子5拼接位点内的“ag”突变为“aa”。1.2.5迷你基因与PTB共转染我们选用主要表达CEACAM1L的H1944细图1CEACAM1LandCEACAM1S在NSCLC细胞株中的表达图4H1944细胞株中与PTB共转染后迷你基因L/S表达谱图2肺癌组织中PTB的m培养皿中长至约80%,加入DNA/lipofectAMIM混合物(10μg/40μl,室温放置40min)和4ml无血清、无抗生素的培养基混合物加入细胞中,37℃

6、培养6h后,更换为含有血清、抗生素的培养基。转染72h后收集细胞,用RNAzol提取总RNA,每种载体重复转染3次。用位于外显子6中的序列作为引物S1:5'GGTTGCTCTGATAGCAGTAG3'和载体上的T7序列为引物:5’TAATACGACTCACTATAGGGAG3’,来扩增转染的CEACAM1迷你基因的表达产物。PCR反应条件如下:94℃变性1min,55℃退火1min,72°C延伸2min,25个循环,PCR产物经测序鉴定。2结果2.1RT“Hot”PCRRT“Hot”PCR结果见图1,CEACAM1两种产物的表达有细胞特异性,在H1944及A549细胞株中,

7、主要以CEACAM1L的形式存在,而在大部分其他细胞株中,则主要以CEACAM1S的形式存在。2.2PTB的1L低表达有明显的相关性。在肿瘤组织中,PTB明显高表达,而CEACAM1L表达水平较癌旁组织明显下降。2.3重组载体的构建PCR得到的约为1.6kb的DNA片段,经酶切连入真核表达载体pCMV,构建的重组载体经测序鉴定无误,阅读框不变。2.4迷你基因的表达及与PTB共转染我们选用主要表达CEACAM1L的H194

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