海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1的克隆与生物信息学分析本科毕业论文

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1、河北农业大学本科毕业论文论文题目海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1的克隆与生物信息学分析材料目录：1、任务书（1）份2、开题报告（含文献综述）（1）份3、指导教师评阅书（1）份4、答辩记录表（1）份5、论文正文（1）份6、其它材料专业名称农学论文题目海岛棉抗黄萎病基因GbEDS1的克隆与生物信息学分析题目来源国家自然科学基金目的意义：我国目前推广的棉花品种抗黄萎病性能差，不能满足市场的需要。因此，培育抗黄萎病棉花品种，是当前棉花育种迫切需要解决的问题。近年来，植物发育生物学研究取得了突飞猛进的发展，许多重要的

2、发育机制在分子水平上得以阐明，这就为利用遗传工程的方法改造植物生长发育过程奠定了基础。抗黄萎病基因的研究能为品种改良提供依据，具有显著的学术理论价值和潜在经济价值。本研究利用RT-PCR和RACE技术从海岛棉克隆抗黄萎病相关基因EDS1的cDNA及开放阅读框序列（Openreadingframe，ORF），并通过生物信息学分析，以预测该基因在棉花抗黄萎病过程中所起的作用，为基因功能验证提供理论依据。可行性分析：1、研究条件课题组已有利用电子克隆方法、RT-PCR和RACE技术，从棉花中克隆出抗黄萎病相关基因的

3、先例，并对基因进行了表达特异性分析、原核表达分析。同时课题组成员熟练掌握分子生物学理论基础和实验技术、生物信息学的应用因此，具备开展基因克隆技术和条件。本实验室为河北省重点学科――作物遗传育种实验室和河北省作物种质资源重点实验室，具有先进的仪器设备条件，完全能够满足本研究的需要。因而在人员和仪器设备条件方面也是可行的。2、预期结果获得GbEDS1基因cDNA全长2190bp，开放阅读框长1848bp。对该基因进行生物信息学分析预测其功能并为其功能的研究奠定理论依据。3、可能存在的问题从棉花样品中高效地提取完整

4、的RNA，由于其植物体内多糖多酚含量高，给提取带来难度。进度安排：2013.3.1-2013.3.15:查找国内外相关文献，学习与本试验有关的实验技术，制定实验方案。2013.3.15-2013.3.25：提取棉花总RNA，获得质量较高的RNA，进行cDNA的片段合成。2013.3.25-2013.4.25：设计并合成相关引物，扩增棉花相关基因GbEDS1及全长ORF，克隆并测序。2013.4.25-2013.5.10：对基因进行生物信息学的分析，从而预测基因的功能。2013.5.10-2013.5.30：整

5、理实验材料，撰写论文，准备答辩。专家意见：专家签字：年月日学院意见:院长：年月日农学院农学专业刘通学生：现把2012-2013学年，第二学期的毕业论文安排下达给你，你本学期承担的毕业论文任务如下：1、依据本任务书中论文题目、目的意义、可行性分析的内容完成开题报告。2、按照开题报告的要求按期完成毕业论文各项工作的实施。3、完成毕业论文的撰写。4、完成毕业论文的答辩。请按相关要求完成毕业论文任务。教师签字：2012年5月4日河北农业大学本科毕业论文开题报告题目：海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1的克隆与生物信息学

6、分析学院：农学院学生姓名：刘通专业：农学班级学号：2009014010216指导教师姓名：张艳指导教师职称：讲师2012年6月5日学生姓名刘通专业班级农学0902学号2009014010216指导教师张艳职称讲师所在学院农学院论文名称海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1的克隆与生物信息学分析选题依据：理论依据本研究根据不同物种的EDS1核酸保守区域设计简并引物，利用RT-PCR和RACE技术从海岛棉克隆抗黄萎病相关基因EDS1的cDNA及开放阅读框序列（Openreadingframe，ORF），并利用生物信息

7、学软件分析序列特征特性。目的意义棉花是世界上重要的经济作物，据估计，棉花创造的年产值达1800-2000亿美元，全世界有18亿人口以种植棉花为生[1]。棉花在整个生长过程中都受到病害的威胁，而黄萎病是棉花病害中对生产和产量威胁最大、危害最重的病害。棉花黄萎病（Verticilliumwilt）是一种土传真菌性病害，由于其寄主广泛、土壤传播快、抗逆性强和变异性大等特点，已经成为棉花生产上第一大病害[2]。随着植物抗病机理研究的不断深入和基因工程手段的运用，通过向棉花中定向导入外源抗病基因以提高棉花对黄萎病的抗性

8、，创造新的抗病种质已经成为防治黄萎病的有效途径[3,4]。EDS1（enhanceddiseasesusceptibility1）基因在1999年被首次克隆[5,6]，研究表明，EDS1是烟草中RPS4调节的过敏反应HR所依赖的一个信号元件[7]；番茄中Ve1介导的对大丽轮枝菌的抗性反应依赖于EDS1和NDR1[8,9]；葡萄EDS1基因具有抗白粉病的作用[10]。EDS1诱导了R基因控制的抗性，即