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时间:2018-10-22
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1、基于转录组测序的山茱萸次生代谢生物合成相关基因的挖掘 [摘要]为探讨山茱萸中环烯醚萜等次生代谢产物合成的遗传基础,采用新一代高通量测序技术对其果实进行转录组测序,共获得得96032条unigenes,平均长度59053bp;其中共有35478条unigene能被NR,Swissprot,COG,GO,KOG,Pfam和KEGG等7个公共数据库注释。通过对注释所得的unigene进行KEGG代谢通路的分析发现,共有84个unigene与环烯醚萜类成分的生物合成有关;487条unigene参与山茱萸其他次生代谢相关物质代谢调控。研究发现,共有153条un
2、igene参与山茱萸次生代谢产物的氧化/羟基化;72条unigene参与次生代谢产物的糖基化。该研究首次对山茱萸转录组进行了分析,并获得了山茱萸环烯醚萜类等次生代谢生物合成相关的候选基因,为山茱萸的分子生物学研究提供了丰富的数据资源,也为后续探讨候选基因的功能奠定了基础。 [关键词]山茱萸;转录组;次生代谢 Transcriptomeanalysisrevealsgenesinvolvedinbiosynthesisof secondarymetabolisminCornusofficinalis ZHUYunhao,DONGChengming
3、,ZhengQiaoke,FENGWeisheng,LIUMengqi,ZHAOLe* (CollaborativeInnovationCenterforRespiratoryDiseaseDiagnosisandTreatment&ChineseMedicine DevelopmentofHenanProvince,SchoolofPharmacy,HenanUniversityofTraditional ChineseMedicine,Zhengzhou450046,China) [Abstract]Inordertoexploregene
4、ticbasisforthebiosynthesisofsecondarymetabolism,thetranscriptomeofCornusofficinaliswassequencedbythenewgenerationofhighthroughputsequencingtechnology,Atotalof96032unigeneswereassembledwithanaveragelengthof59053bpAmongthem,35478unigeneswereannotatedinthepublicdatabasesNR,Swisspro
5、t,COG,GO,KOG,PfamandKEGGBasedontheassignmentofKEGGpathway,84involvedinridoidbiosynthesisand487unigenesinvolvedinotherssecondarymetabolitesbiosynthesiswerefoundAdditionally,53unigenesand72unigeneswerepredictedtohavepotentialfunctionsofcytochomeP450andUDPglycosyltransferasesbasedo
6、ntheannotationresult,whichmayencoderesponsibleforsecondarymetabolitesmodificationThisstudywasthefirstcomprehensivetranscriptomeanalysisforCofficinalis,andthecandidategenesinvolvedinthebiosynthesisofsecondarymetaboliteswereobtainedThetranscriptomedataconstitutesamuchmoreabundantg
7、eneticresourcethatcanbeutilizedtobenefitfurthermolecularbiologystudiesonCofficinalis [Keywords]Cornusofficinalis;transcriptome;secondarymetabolites 山茱萸CornusofficinalisSiebetZucc为山茱萸科多年生落叶乔木或灌木,其成熟干燥果实入药具有补益肝肾、收敛固涩的功效,常用于眩晕耳鸣、肝虚寒热等症。现代药理学研究表明,山茱萸具有免疫抑制、血糖调节、抗血小板聚集、抗菌、抗炎等作用[1],
8、而其果实中富含的山茱萸苷、马钱苷、莫诺苷等环烯醚萜类及黄酮、三萜类等次生代谢产物可能是其发挥上
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