中国17个汉族人群3个str基因座的遗传关系研究

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1、中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系研究龙友国,邱祥智,龙思方,余跃生,戎聚全【摘要】目的探讨中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系。方法收集中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,计算他们间的遗传距离,构建系统发生树。结果江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳汉族聚为一大类,泉州、广东、福建、潮汕汉族为一类,荆州、成都、湖南、西安和贵州汉族为一类,而广西汉族单独为一类。结论研究结果与遗传学和民族学研究结果一致,并提示17个汉族人群STR基因频率分布与地理距离呈平行关系。【关键词】STR;遗传距离;系统发生树;群体遗传学;

2、汉族;中国  Abstract:ObjectiveTostudythegeicrelationship(3shorttandemrepeatgeneloci,abbreviatedas3STRgeneloci)in17groupsofHanpopulationinChina.MethodsGeicdataofD16S539,D7S820,andD13S317STRgenelocion17groupsofHanpopulationongseventeengroupsofHanpopulation.ANeighbor-JoiningmethodicrosatelliteDNA),又称短

3、串联重复序列(shorttandemrepeat,STR),约占人类基因组的10%,重复单位长1~6bp,重复次数10~60次,等位基因片断长度一般在100~500bp。它因数目多、分布广,并具有高度多态性、高信息含量以及高杂合度而被广泛应用于人群遗传学、法医个体识别、人类学、民族学和考古学等领域[1]。黄辰等[2]利用D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料对我国7个民族间的遗传关系进行了研究,但尚未见有利用这几个基因座对汉族人群遗传关系研究的报道。笔者收集成都、湖南、贵州、河南、西安等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座基

4、因频率的文献资料,以探讨他们间的遗传关系,对了解汉族的起源、进化和迁移具有较高的参考价值。  1对象与方法  1.1研究对象收集中国安徽、成都、湖南、福建、江苏、贵州、江西、台湾、潮汕、广西、泉州、太原、河南、西安、荆州、广东和深圳等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,各基因座的基因型频率分布均符合Hardy-EGA3.1统计软件包计算17个汉族人群间的Nei’s遗传距离,并通过Neighbor-joining法构建系统发生树。  2结果  2.1Nei’s遗传距离17个汉族人群的Nei’s遗传距离,见表1。结果显示:成都汉族和泉州汉

5、族的遗传距离最小(0.0025),广西汉族和江苏汉族的遗传距离最大(0.1229)。  2.2系统发生树根据Nei’s遗传距离,采用NJ法构建的系统发生树,见图1。结果显示:江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳等7个汉族人群聚为一大类,泉州、广东、福建和潮汕汉族聚为一类,荆州、成都、湖南、西安和贵州汉族聚为另外一类,广西汉族与其他地区汉族人群关系较远单独成为一类。由此可以看出,中国汉族人群STR基因座的基因频率分布与地理距离呈平行关系。  表1中国17个汉族人群间的Nei’s遗传距离(略)  图1中国17个汉族人群的系统发生树(Neighbor-joining法)(略)  3讨

6、论  汉族是我国和世界上最大的民族,其人数最多,分布最广。不同地区的汉族人群在语言、文化和生活习惯上存在着明显差异。笔者运用文献提供的中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,探讨他们间的遗传关系,将为了解汉族的源与流提供理论依据,并为语言学、民族学、历史学和考古学等学科的研究提供参考资料。(责任编辑:admin)  杜若甫等[3]通过对30个汉族人群ABO血型等38个基因座的基因频率进行聚类分析,结果以长江为界分为南北两大群:北方群包括长江以北等省、市、自治区及地跨长江两岸的安徽、江苏两省。南方群分两支,一支是广东、广西、海南、福建、台湾

7、;另一支包括浙江、江西、湖南、贵州等长江以南各省和地跨长江两岸的湖北、四川、云南三省。南方群的台湾、上海等汉族人群则与北方人群聚为一类。而笔者得出与其基本一致的结论,即安徽、江苏、台湾和深圳汉族也与北方汉族聚为一类。  古代中原是汉族的起源地,西晋时期以后,位于中原的河南、陕西、山西等地区的汉族大量迁往安徽、江苏和江西等地,这些地方多平原,地理隔离少,加上近五千年来由战乱、灾荒所引起的大规模、频繁的人口迁移,使这些地方汉族人群存在着基因融合;在地域分布上,河南、山西、

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