拟穴青蟹微卫星标记开发与应用的的研究 (1)

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1、上海海洋大学硕士学位论文2、利用9对微卫星引物对我国东南沿海拟穴青蟹11个地理群体397个个体进行了遗传多样性分析,9个位点在11个群体共检测至lJl04个等位基因,平均每个位点有11.6个等位基因,其中位点Scypal的Ⅳa最少(6个),位点Scypa8和Scpa03最多(16个);Ⅳe在2.5~11.8之间,平均每个位点5.3个;各个群体的平均凰和魄分别在o.62~O.771和o.66--0.76之间。对11个群体的分子方差分析(AMOVA)结果显示,群体间的遗传分化系麴=0.0138,即总的遗传

2、变异中有1.38%的变异来自群体间,98.62%的变异来自群体内。根据遗传距离采用UPGMA法对11个群体进行聚类分析,深圳群体和漳州群体间的遗传距离最小(O.0121),先聚合在一起,三门群体与其它群体间的遗传距离较大。总的来说,各个群体均具有较高的遗传多样性,且平均杂合度呈现出自南向北逐渐降低的趋势,而群体间的遗传分化程度较低。这一结果为拟穴青蟹种质资源的保护以及人工育种等工作提供了科学依据和资料支持。3、利用8个微卫星标记对拟穴青蟹6个家系共275个个体进行了遗传多样性分析,共检测到50个等位基

3、因,平均每个位点4~8个,其中3个家系各自在1个位点表现为单态,8个位点的PIC、Ho和HE分别在0.40,--0.77、0.33~0.81和0.42~0.80之间。对6个家系的AMOVA分析结果显示,家系间的遗传分化系数Fsr=0.2057,即总的遗传变异中有20.57%的变异来自家系间,79.43%的变异来自家系内。根据遗传距离采用UPGMA法对6个家系进行聚类分析,4号家系和5号家系之间的遗传距离最小,先聚合在一起,2号家系和6号家系间的遗传距离最大.总的来说,各个家系的平均杂合度与野生群体接近

4、,但家系间的遗传分化程度远大于野生群体间的分化。这一结果对拟穴青蟹家系选育具有重要的指导意义,不但了解了种质资源情况,也有助于在家系选育过程中避免近交衰退、有效群体减少等不良现象的产生。系关键词拟穴青蟹,微卫星标记,5’锚定PCR,遗传多样性,野生群体,家上海海洋大学硕士学位论文Developmentofmierosatellitemarkersandtheirapplicationinmudcrab,ScyllaparamamosainABSTRACTThemudcrabScyllaparamamo

5、sainisanimp()rtantmarineaquaculturecrabinChimanditismainlydistributedabngthelndo-WestPacificregionsandthesoutheastofChina.WiththedevelopmentofmarketdemandsandaquacuRm'escab'itisimportanttodevelopancwvarietywithhighyieldandstressresistance.Geneticdiversi

6、tyisdecidedbygeneticvariationandgeneticstructureandit'scloselyrehtedtothepotentialofevolutionandabilitytowithstandadverseenvironments.Therefore,thestudyofgeneticdiversityhasimportanttheoreticalsignificanceandapplicationvalueforspeciesconservationandmain

7、temnceofecologicalbalance.5’anchoredPCRtechniquewasusedtodevelopmentmicrosatellitenmrkersfrom¶mamosaininthisprojectandeighteenpob,TnorphicmicrosatellitemarkerswereD3tten.Thenweusedthesemicrosatellirelocitoamlyzegeneticdiversityandgeneticdifferentiat

8、ioninelevenwildpopulatiomandsixfamiliesof¶mamosain,respectively.Theimportantresultsas白Ilows,l、Inthisstudy,wedeveloped18polymorphicmicrosatellitemarkersin,thisimportantcrabby5’anchoredPCRtechnique.Atotalof125allelesweredetecte

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