转基因食品dna提取及寡核苷酸芯片检测技术的研究论文

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1、硕士学位论文}Y2257692IIIIIIIIIIIIIIIIIII⋯转基因食品DNA提取及寡核苷酸芯片检测技术的研究硕士研究生:蔡翠霞指导教师:马文丽教授摘要转基因生物(GeneticallyModifiedOrganism,GMO)是利用现代分子生物技术,将某些生物的基因转移到其他物种中,改造生物的遗传物质,使其在形状、营养品质、消费品质等方面向人们所需要的目标转变。以转基因生物为直接食品或为原料加工生产的食品就是“转基因食品(GeneticallyModifiedFoods,GMF)’’【11。随着基因工程技术的日趋成熟及在农产品上的广泛应用,转基因食品应运而生,并以惊

2、人的速度进入人们的生活。2011年全球转基因作物种植面积达1.6亿公顷,比1996年的170万公顷增长94倍12],而以转基因作物为原材料加工的食品已达上万种。转基因食品给人类带来了丰富的食品供应和巨大的经济效益,但到目前为止,转基因食品对人类健康的安全性一直受人们质疑【3,41。某些转基因食品引起中毒、过敏反应、降低人体抵御病毒的能力、改变机体肠道菌群平衡等危害已有报道【5一。为了维护消费者的知情权和选择权,世界上的很多国家和地区先后出台了相应的法律和管理方法,对转基因食品实行强制标识或自愿标识。2002年我国农业部颁布的《农业转基因生物标识管理办法》,规定对5大类17种产

3、品必须进行标识【7J。对转基因食品进行标识基于能检测到转基因成分。因此建立准确、快速、高效的转基因成分检测技术至关重要,而高质量DNA模板的获取,是转基因食摘要品进行基因检测的前提和关键。核酸提取包含样品的裂解和纯化两大步骤。裂解是使样品中的核酸游离在裂解体系中的过程,纯化则是使核酸与裂解体系中的其它成分,如蛋白质、多糖、盐等杂质彻底分离去除的过程。裂解方法包括化学裂解法(表面活性剂SDS、CTAB、高盐等)、酶裂解法(蛋白酶K、溶菌酶、裂解酶等)和机械裂解法(研磨等)f8】。最常用的纯化方法,一是有机溶剂抽提再沉淀,二是介质纯化。介质纯化是利用某些固相介质,在特定的条件下选

4、择性吸附的特点,实现核酸与蛋白质及其他杂质的分离。由于加工食品成分复杂,DNA破坏降解严重,因此从加工食品中提取DNA,潜在困难很大。目前国内外很多学者在积极探索、深入研究各种高效的转基因食品DNA提取方法。本研究针对转基因食品的不同加工程度,构建和优化了各种加工程度的食品DNA的提取方法。首先,对于转基因农产品,采用Chelex一100法快速提取转基因农产品DNA,Chelex.100是一种由苯乙烯和苯二乙烯共聚体组成的化学离子螯合树脂,其悬液在碱性环境(pHl0一l1)和100。C的条件下,可导致细胞破裂,DNA从细胞核中释放,同时Chelex.100能结合许多可能影响下

5、一步分析的非核酸物质【91。由于Chelex.100能有效除去非核酸有机物,并且通过结合金属离子,防止DNA降解,具有经济、简便、高效等优点,目前已被广泛用于从微量血液、组织斑块、精斑、骨骼等法医物证检材【10.151。本研究比较国标(GB/T19495.3.2004)CTAB.1法和Chelex.100法提取转基因大豆GTS40.3.2DNA浓度和纯度,对检测结果进行统计学分析,结果显示Chelex.100法提取的DNA浓度较国标CTAB.1法高(t浓度=10.424,P浓度--0.000),而纯度较CTAB.1法低(t蚴r=12.684,P纯度=O.ooo),但是作为模板

6、用于PCR扩增,效果与CTAB.1提取方法并无明显差别;对比两种方法提取的DNA在.20。C下保存一个月内的PCR检测效果,结果未见明显差别;将Chelex.100法应用于其他农产品的DNA提取,效果理想。其次,对于轻中度加工食品,采用改良传统的CTAB法。CTAB法是提取植物DNA的经典方法,也是文献报道最多的提取转基因食品DNA的方法¨6。91,TI硕士学位论文但是传统的CTAB法由于操作繁琐,耗时长,试剂组成复杂,酚、氯仿等有机溶剂易造成环境污染等问题,在使用上受到一定的限制。本研究改良传统CTAB法,利用硅膜吸附柱纯化DNA,减少应用氯仿等有毒的有机溶剂,大大缩短了操

7、作时间,比较该方法与国标(GB/T19495.3.2004)CTAB.1法提取转基因大豆GTS40.3.2DNA的浓度和纯度,对检测结果进行统计学分析,结果显示改良CTAB法提取的DNA浓度和纯度均较国标CTAB.1法高(t浓度=9.471,P浓度=o.001;t纯度=3.253,P纯度:0.0S1),差异具有显著性意义,表明该方法提取的DNA效果较理想,同时将其应用于轻中度加工食品的DNA提取中,取得理想效果。第三,针对油脂经过深加工,DNA含量低,且受破坏严重,提取难度大的特点,本研究利用硅膜吸附柱

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