鲤选育群体与野生群体的选择压力分析

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101091上海海洋大学硕士学位论文题目：鲤选育群体与野生群体的选择压力分析Selectionpressureanalysisinselectiveand英文题目：wildcommoncarp(CyprinuscarpioL.)专业：水产养殖研究方向：水产动物种质资源与种苗工程姓名：许丽花指导教师：王成辉教授二O一二年五月上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何

2、其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月

3、日日期：年月日上海海洋大学博/硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注李思发上海海洋大学教授（博导）主席赵金良上海海洋大学教授（博导）委员傅萃长复旦大学副教授（博导）委员委员委员委员委员唐首杰上海海洋大学讲师秘书答辩地点水产与生命学院C217答辩日期2012.5.25鲤选育群体与野生群体的选择压力分析摘要选择压力是驱使群体遗传分化的主要驱动力。不同的选择压力可能导致群体不同的分化方向，对群体的影响也会有所不同。鲤（CyprinuscarpioL.）在经历长期的养殖驯化过程中，会承受较强选择压力，特别是人工选择压力。近期关于线粒体DNA和微卫星

4、分子标记的选择压力分析备受关注，并且已有一定的进展。但人工选择压力是怎样影响群体遗传分化还有待于研究。本论文应用三种方法对2个鲤野生群体和4个选育群体进行遗传多样性、群体结构、选择压力分析研究。具体内容为：1、鲤选育与野生群体选择压力的微卫星标记分析通过微卫星标记分析，对2个长江鲤野生群体（长江下游江苏扬州江段，长江中段湖北石首江段）和4个选育群体（兴国红鲤，荷包红鲤，玻璃红鲤，建鲤）进行遗传多样性和遗传分化分析，进而探讨选择压力对群体遗传分化的影响。结果显示，与野生群体相比较，选育群体表现为较低的遗传多样性、较高的近交系数和群体间遗传分化，以及群体内

5、较严重的连锁不平衡现象。说明在选育期间，强烈的选择压力作用于选育群体。发现在分析的10微卫星位点中，选育群体有5个位点处于正向选择，而野生群体未检测到正向选择压力，处于自然I环境下的平衡净化选择。较强的选择压力（包括人工选择压力）致使鲤选育群体与野生群体间遗传分化显著。2、鲤选育与野生群体选择压力的线粒体D-loop区序列分析通过线粒体DNA的D-loop区序列分析，发现：较野生群体，选育群体的遗传多样性较低、群体内近交系数较高、群体间遗传分化较为明显。选育群体的单倍型数目较野生群体少，且一部分单倍型来源于野生群体，每个选育群体的单倍型类型不同，其单倍

6、型分布显示出明显的极化现象。说明4个选育群体在人工选育过程中受到了强烈选择压力影响，不同的选育方法（选择压力）导致不同群体的分化方向差异极大。3、鲤群体MHCII类β基因的分析研究这一部分对6个鲤群体的MHCII类基因的第2外显子和2个相邻的内含子序列进行克隆、测序和选择压力检测。遗传多样性分析显示，选育群体与野生群体间并不存在显著的差异；遗传分化分析显示，荷包红鲤与其他鲤群体的分化极为显著；选择压力位点检测显示，除长江中部野生群体可能受到中性选择外，其他群体大部分的位点受到了净化选择作用。这个结果与微卫星分析和线粒体序列分析有所出入。推测是因为在养殖

7、和自然进化过程中，MHC基因由于对免疫反应极敏感，在选择压力驱动下变异较多，导致不同群体的针对这一基因的II遗传差异不明显。关键词：鲤，线粒体DNA，微卫星标记，主要组织相容性复合体基因（MHC），选择压力IIISelectionpressureanalysisinselectiveandwildcommoncarp(CyprinuscarpioL.)ABSTRACTSelectionpressuresaretheprincipleevolutionaryforcesforgeneticdifferentiationofpopulations.Rece

8、ntadvancesinselectionpressuresonmitochondrialDN