肉瘤类金鱼群体遗传关系的微卫星分析

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101084上海海洋大学硕士学位论文题目：肉瘤类金鱼群体遗传关系的微卫星分析英文题目：Microsatellite-basedgeneticstructureandrelationshipofgoldfish(Carassiusauratus)withsarcoma专业：水产养殖研究方向：水产动物增养殖姓名：胡彩霞指导教师：陈再忠副教授二0一二年五月上海海洋大学博/硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注王武上海海洋大学教授主席陈亚瞿东海研究所研究员委员陈再忠上海海洋大学副教授委员刘利平上海海洋大学副教授委员马旭洲上海海洋大学副教授委员

2、张文博上海海洋大学讲师秘书答辩地点水产与生命学院B105答辩日期2012.05.15上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论

3、文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日肉瘤类金鱼群体遗传关系的微卫星分析摘要金鱼(Carassiusauratus)不仅在中国是一种非常重要的观赏鱼，而且在世界各地都非常流行。众所周知，金鱼是野生鲫鱼的突变体经长期人工选育而来的。在长期的选育过程中金鱼的品种逐渐增多。因为金鱼的体色和外部形态的多变，其各种变异非常丰富，这在动、植物变异中是十分罕见的。其中按照金鱼头上的肉

4、瘤来分，可以分为高头类、狮头类和虎头类。金鱼的肉瘤从某种意义上来说其实是一种病态组织，属于金鱼头部的赘生物。其存在加重了金鱼头部和鳃盖的负担、甚至会影响到金鱼的呼吸。肉瘤随着金鱼的生长过程逐渐增大，刚孵化的高头幼鱼的头部并非一开始就能长出肉瘤，需要经过几个月的饲养之后才会在头部逐渐长出。目前虽能较好地培育、繁殖出具有美丽而丰满的头瘤，但是从遗传学的角度对这些肉瘤类品系金鱼的形成成因等还不清楚。因此通过从遗传物种DNA的角度来分析肉瘤类金鱼的遗传多样性、品种间的遗传差异等都具有十分重要的意义。本研究从金鱼群体微卫星的标记开发、肉瘤类金鱼群体的分子遗传变异和遗传进化关系等方面进行研究分析，

5、具体研究内容如下：1、金鱼的微卫星标记开发金鱼最早起源于野生鲫鱼，在后期的饲养和人工选择下而演化出各种不同的品系金鱼。比如龙睛金鱼、蛋种金鱼和琉金金鱼。在本研究中，我们利用磁珠富集法开发了金鱼的18对微卫星引物。并应用于60尾不同品种的金鱼样本的遗传变异来检测其有效性。结果显示每个引物的等位基因数在2到6之间，观测杂合度和期望杂合度分别是0.1500-0.9167和0.3125-0.7840。这18个微卫星位点均不偏离哈迪-温伯格平衡。这些微卫星标记可以为不同金鱼群体结构和遗传变异等方面的研究提供了工具。2、不同肉瘤类金鱼群体之间的遗传变异水平与遗传关系研究运用SSR分子标记首次对六个

6、肉瘤类金鱼群体（鹤顶红、黄顶白高头、红狮头、黑狮头、红虎头及白虎头金鱼）的遗传结构、瓶颈效应以及遗传关系进行了研究，并对这些新开发的金鱼多态性微卫星进行了评估。结果显示这六个肉瘤类金鱼群体间的遗传分化显著，但绝大多数遗传变异来源于个体内，而非群体间。各群体间的遗传分化达到显著水平，其中白虎头金鱼群体与红虎头金鱼群体之间的遗传分化水平最低，而与其他四个肉瘤类金鱼群体之间的遗传分化较高。主成分分析和贝叶斯聚类结果显示，鹤顶红金鱼群体与其他五个肉瘤类金鱼群体存在明显的遗传差异，白虎头金鱼群体与红虎头金鱼群体群体遗传关系较近，这两个金鱼群体与其他四个群体遗传关系较远，黄顶白高头金鱼群体、红狮头

7、金鱼群体I以及黑狮头金鱼群体这3种金鱼群体遗传关系最近。红狮头金鱼、黑狮头金鱼、鹤顶红金鱼和黄顶白高头金鱼等以上金鱼肉瘤类金鱼群体在引入过程中经历过遗传瓶颈。而所有的红虎头金鱼和白虎头金鱼群体均不存在显著的遗传瓶颈效应。关键词：肉瘤类金鱼，微卫星标记，遗传变异，遗传瓶颈IIMicrosatellite-basedgeneticstructureandrelationshipofgoldfish(Carassiusauratus)withsarc