微卫星标记在牙鲆(paralichthys olivaceus)增殖放流中的应用研究

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1、上海海洋大学硕士研究论文学校代码:10264研究生学号:M100101046上海海洋大学硕士学位论文微卫星标记在牙鲆(Paralichthysolivaceus)增殖题目:放流中的应用研究Applicationofmicrosatellitemarkerstoevaluatethe英文题目:effectofParalichthysolivaceusstockenhancement专业:水产养殖研究方向:鱼类遗传育种姓名:陈睿毅指导教师:刘海金二〇一三年六月上海海洋大学硕士研究论文上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明:我恪守学术道德,崇尚严谨学

2、风。所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写,我对所写的内容负责,并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅或借阅。本人授权上海水产大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描

3、等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□,在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密■学位论文作者签名:陈睿毅指导教师签名:刘海金日期:2013年6月24日日期:2013年6月24日上海海洋大学硕士研究论文上海海洋大学博/硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注高天翔中国海洋大学教授主席牛翠娟北京师范大学教授委员刘晓清华大学副教授委员中国水产科学张晓琴研究员委员研究院中国水产科学李继龙研究员委员研究院中国水产科学副研究刘永新秘书研究院员中国水产科学答辩2013.5.24答辩地点研究院日期14:00上海海洋大学硕士研究论文微卫星标记在牙鲆(

4、Paralichthysolivaceus)增殖放流中的应用研究摘要牙鲆(Paralichthysolivaceus)是我国重要的海洋经济鱼类之一,它不仅是我国重要的捕捞对象,也是主要的海水增养殖鱼类。近年来,由于沿海污染严重,加之捕捞过度,牙鲆自然资源急剧下降。人们通过人工放流来增加群体数量,但是对其增殖效果却一直未能精确评估。作为解决这一问题的关键之一,即区分放流牙鲆和野生牙鲆的技术尚有待建立。本研究分两部分,一是利用多态性微卫星标记对养殖牙鲆进行了亲子鉴定,分析鉴定准确率与微卫星标记之间的关系,并在此基础上比较不同亲本对子代贡献率的差异。二是

5、以牙鲆亲鱼和回捕牙鲆为研究对象,采用亲子鉴定的方法,从回捕牙鲆中区分出放流牙鲆和野生牙鲆,并对三者的遗传多样性进行比较分析。获得的主要研究结果如下:(1)利用18对高度多态性微卫星标记,对13尾(5♀,8♂)牙鲆(Paralichthysolivaceus)亲鱼的188尾后代进行亲子鉴定,计算其非亲排除率、鉴定准确率以及亲本对子代的贡献率。18个标记的平均非亲排除率为0.783,其中POLI-003-HFS最高,为0.916,Newpao202和Poli1617最低,为0.604。结果表明,使用4个微卫星标记进行亲子鉴定,累积排除率≥0.9999,

6、准确率为92.02%;用6个标记的累积排除率≥0.999999,准确率为96.81%;用8个标记的累积排除率≥0.999999999,准确率为97.87%;用10个标记的准确率为99.47%;用12~18个标记的准确率为100%。亲缘关系会影响亲子鉴定的准确率,亲子鉴定准确率随非亲排除率和微卫星标记数目的增多而升高。所有子代全部是实验亲本的后代,即13个亲本对子代均有贡献,但不同亲本的贡献率不同,最高为47.34%,最低为0.53%。(2)从经过实验验证的18个微卫星标记中挑选出8个微卫星标记对321尾回捕牙鲆进行亲缘关系鉴定,结果为91尾是放流牙

7、鲆,其余230尾是非放流牙鲆,放流牙鲆占回捕鱼的28.35%,非放流牙鲆占71.65%。对亲本群体、放流群体和野生群体进行了遗传多样性分析:3个群体在8个多态性位点共检测到103个等位基因,每个位点平均等位基因数为12.88,显示出较为丰富的基因库。3个群体的平I上海海洋大学硕士研究论文均观测杂合度分别为0.8115、0.7756和0.7827,平均期望杂合度分别0.8257、0.7858和0.8154,平均观测杂合度均小于平均期望杂合度,表明3个群体存在一定程度上的杂合子缺失现象。3个群体的平均多态信息含量依次为0.7998、0.7550和0.7

8、932,平均Shannon's指数分别为2.0076、1.8499和2.0028,表现出较高的遗传多样性。3个牙鲆群体都具

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