基于网络模型的基因相关预测问题算法研究

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1、作者简介郭杏莉，陕西宝鸡人。2002年毕业于西安电子科技大学获学士学位。2005年毕业于西安电子科技大学获硕士学位。2013年6月获西安电子科技大学工学博士学位。导师：高琳教授。主要研究方向：计算生物信息学、图论及组合优化算法。代表性成果及经历：攻读博士期间在((NucleicAcidsResearch))、((PLoSONE》《科学通报》、《软件学报》以第一作者发表了研究文章。参与高琳教授的多项科研项目，包括：国家自然科学基金重点项目“生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术”，国家自然科学基金重大研究计划项目“复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与

2、方法研究”，国家自然科学基金资助项目“生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究”，以及高等学校博士学科点专项科研基金“基于图挖掘的蛋白质网络功能模块识别算法”，主持中央高校基本科研业务费“基于双色网络的长非编码RNA功能预测算法研究”。XingliGuo，wasbominBaoji，ShaanxiProvince，China,in1979．ShereceivedherB．A．inSchoolofComputerScienceandTechnologyfromXIDIANUniversity，Xi’an，China,in2002，theM．S．de

3、greeinSchoolofComputerScienceandTechnologyfromXIDIANUniversity，Xi’all，China,in2005，andthePh．D．degreeinSchoolofComputerScienceandTechnologyfromXIDIANUniversity，Xi’an，China,inJune2013．HerresearchinterestsincludeComputationalbiology,algorithmsofgraphtheoryandoptimization．Shehaspub

4、lishedfirst-authoredpapersinthepeer-reviewedjournals，suchas《NucleicAcidsResearch))，((PLoSONE))，((ChineseScienceBulletin))，((JournalofSoftware))．ShehasparticipatedinseveralNSFCprojcots，andsheisalsoaspincipleinvestigatorintheprojectoftheFundamentalResearchFundsfort11eCentralUnive

5、rsities，namedas”Algorithmsforlongnon-codingRNAfunctionpredictionbasedonbi．colorednetworks”．西安电子科技大学学位论文独创性(或创新性)声明秉承学校严谨的学风和优良的科学道德，本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢中所罗列的内容以外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果；也不包含为获得西安电子科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在

6、论文中做了明确的说明并表示了谢意。申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担一切的法律责任。本人签名：Et期：卫丛签：!生关于论文使用授权的说明本人完全了解西安电子科技大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属西安电子科技大学。学校有权保留送交论文的复印件，允许查阅和借阅论文：学校可以公布论文的全部或部分内容，可以允许采用影印、缩印或其它复制手段保存论文。同时本人保证，毕业后结合学位论文研究课题再撰写的文章一律署名单位为西安电子科技大学。(保密的论文在解密后遵守此规定)本学位论文属于保密，在一年解密后适用本授权

7、书。本人签名：二麦一日期：丝蝗：益：!生日期：趔15：鱼：!生导师签名：摘要随着信息技术的飞速发展及各学科基本理论和技术的不断进步及相互渗透，逐渐兴起了多种交叉学科，例如生物信息学，以信息科学的计算方法和技术为手段，以数学理论和模型为基础，采用物理、化学等学科的理论方法及工具，开展生物学问题的研究；尤其是以计算机为主要分析工具的信息科学为生物信息学的发展提供了强有力的支撑。采用计算理论和方法解决生物信息学领域内的问题已经成为信息科学应用研究中极其重要的一部分。立足信息科学开展生物信息学领域内问题的研究，其中重要的一类是针对生物问题的预测算法研究，例如

8、与复杂疾病的发生发展相关的疾病基因预测、基因功能预测、不同类型分子相互作用靶位点预测及相互作用关系的预测等，