牡丹土壤细菌多样性研究现状及进展

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1、本科学生毕业论文（设计）题目学院专业学生姓名学号指导教师职称论文字数完成日期年月日牡丹土壤细菌多样性研究现状及进展摘要:土壤细菌是土壤生态系统的重要组成部分,在土壤有机物质分解和养分释放、能量转移等生物地化循环中起着重要作用。随着人们对生物多样性重要性认识的不断深入及研究方法的不断改进,土壤细菌多样性,尤其是功能多样性的研究工作逐渐受到生态学家的重视。本文从土壤细菌多样性的影响因素以及研究方法等方面阐述了目前国内外土壤细菌多样性的研究现状,并对其未来研究方向进行了展望。关键词:土壤;细菌;多样性;展望Thecurrentsituatio

2、nandprogressofpeonysoilbacterialdiversityAbstractSoilbacteriaareanimportantcomponentofsoilecosystem,soilorganicmatterdecompositionandnutrientrelease,energytransferandotherbiologicalgeochemicalcycleplaysanimportantrole.Withthedeepeningofthepeople'sunderstandingoftheimport

3、anceofbiodiversityandthecontinuousimprovementofresearchmethods,soilbacterialdiversity,especiallythefunctionaldiversityofresearchworkgraduallytotheattentionoftheecologist.Thisarticlefromtheinfluencefactorsofsoilbacterialdiversityandresearchmethodsathomeandabroadisexpounde

4、dtheresearchstatusofsoilbacterialdiversity,andthefutureresearchdirectionwasprospected.Keyword:soil;bacteria;diversity;prospected.目录摘要2Abstract2一.研究方法2二.影响牡丹土壤细菌多样性的因素32.1.牡丹本身32.2土壤类型32.3温度和水分42.4管理方式4三.研究现状5四.牡丹土壤细菌多样性研究进展54.1新技术新方法的应用。54.2各种研究方法有机结合。54.3对土壤细菌功能多样性和功能群的

5、研究54.4将细菌多样性与地区、区域及全球范围的生态学动态分析结合起来。6致谢6参考文献6一.研究方法随生化、分子遗传学和分子生物学技术的发展，一些全新的方法应用于土壤细菌研究。这些新的方法对多样性的分析提高到遗传多样性的水平上。有多种行之有效的分子生物学技术（ZhouJ．Z．andTiedje，1995；HolbenandJanssonetal.，1988）。除了分子杂交、16SrRNA序列分析外，常用的还有如RFLPs、RAPD、REP－PCR、ERIC－PCR等方法。这些分子基因技术能够将那些因为不能被培养而不能用通常方法鉴定的生

6、物种类筛选出来。利用聚合酶链反应（PCR）扩增16SrRNA的方法最常用到。由于16SrRNA基因比较保守，通过分析能够基本反映土壤细菌的多样性（WardandWeller，1990）。其方法步骤可简单概括为，采集土壤样品，在液氮中研磨，提取DNA，得到DNA粗提物，利用凝胶电泳加微型过滤柱或其他的方法进行纯化。然后将纯化的DNA作为进行聚合酶链反应的模板，对目标DNA进行扩增放大并经过电泳检测。用限制性内切酶对克隆产物进行消化，电泳分离，应用分析软件对电泳胶片进行分析，将相同的基因型聚合到一起，各不相同的基因型为惟一的基因型，每一个惟

7、一基因型为一个操作分类单位（OTU）。尽管这项技术不须进行特定生物体的描述，但要弄清楚环境中细菌的数量和联系，特别是与已知序列的基因相似性。而且需要一个大的数据库，也不适合数百个样本的分析（Colwell．R．R．andD．L．Hawkworth，RFLPs即限制性片段长度多态性。最早Grodzicker用在adenoviyuses温度敏感株的突变基因上。其做法一般是通过限制性内切酶识别双链DNA分子中的特定序列，并在特定位点将DNA切开。各种原因造成的DNA的微小改变会造成限制性内切酶识别序列的改变，即消除和产生新的特定酶切位点。另外

8、，大片段的缺失或转移也会造成某些酶切条带的改变。这样对两个个体的DNA分子特定的酶就会在DNA不同的位点切割，DNA分子酶解后，形成不同长度的DNA片段。这些大小不等的片段通过凝胶电泳时会形成不同的带。用分