微卫星标记在猪遗传育种中应用进展

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1、专论综述微卫星标记在猪遗传育种中的应用进展尚邦华，连林生（云南农业大学动物科学技术学院，云南昆明650201）【摘要】本文简要介绍了微卫星标记的原理和优点，以及微卫星标记在制作猪DNA指纹图、鉴定亲缘关系、分析群体遗传结构及遗传多样性、构建遗传连锁图谱、定位QTL和功能基因、标记辅助选择、群体近交分析、基因鉴定等等方面的应用新进展。【关键词】猪；微卫星标记；经济性状；QTL【中图分类号】S818.9【文献标识码】A【文章编号】1672－2078（2006）05－0010－04TheApplicat

2、ionStudyofMicrosatelliteMakeronHeredityandBreedinginPigsSHANGBanghua，LIANLinsheng(CollageofAnimalScienceandTechnology,YunnanAgriculturalUniversity,Kunming650201)【Abstract】Thispaperbrieflysummarizedtheprincipleandmeritofmicrosatellitemarker,andnewappli

3、cationstudyinpigonmakingDNAfingerprintmap,identifyingrelationship,analyzinggeneticstructureanddiversity,composinggeneticlinkagemap,QTLandfunctionalgenelocating,markerassistantselecting,populationinbreedinganalyzing,geneidentifying,etc.【Keywords】pig;mi

4、crosatellite;economictraits;QTL分子标记技术是近二十年来继形态学标记、生组成，侧翼序列具有位点特异性，使其特异地定位化免疫遗传标记和细胞遗传学标记后的一种新的于染色体某一位置。而微卫星本身的重复数变异遗传标记技术，它是从DNA水平上来揭示遗传物则提供了微卫星位点产生多态性的基础。微卫星质的遗传变异情况，实现了从表型选择到基因型选DNA呈共显性遗传。在真核生物的基因组中，分择的飞跃。20世纪80年代以来，限制性片段长度布着许多微卫星DNA的简单重复序列，重复次数多态性(

5、RestrictionFragmentLengthPolymorphism为10～20次，真核生物基因组中大约每隔10～RFLP)技术的出现，使人们对DNA的研究更为深15kb就存在一个微卫星标记。微卫星标记很容易入，随着分子生物学技术的不断发展，基于PCR的经PCR扩增和电泳检测。微卫星DNA主要集中各种标记技术也相继出现，如随机扩增多态DNA在非编码区，可能对基团的调节起作用，也可能是(RandomAmplifiedPolymorphicDNA,RAPD)、扩增重组的热点。微卫星标记是目前发展

6、最快的分子片段长度多态性DNA(AmplifiedFragmentLength标记之一，与其它分子标记技术如RFLP、AFLP、PolymorphismDNA,AFLP)、DNA指纹技术(DNAfin-RAPD、SNPs等相比较，微卫星标记在基因组中具gerprintsDFPs)、微卫星DNA(MicrosatelliteDNA)和有数量大、分布广、分布均匀、多态信息含量高及分单核苷酸链多态性DNA(SingleNucleotidePolymor-析方便、适于自动化和半自动化检测等优点，是一phi

7、cDNA,SNPs)等。其中以微卫星DNA标记的应类用途十分广泛的DNA分子标记，其优点具体如下。用最为广泛。1.1保守性1微卫星标记的原理及优点微卫星位点在哺乳动物物种间，特别是一些紧微卫星DNA是一类由几个核苷酸（一般不超密相关的物种，如不同地域的猪品种之间具有一定过6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串程度的保守性。RAPD虽无种属特异性，操作方便，状重复序列,由其核心序列和两侧的侧翼序列共同变异程度相当高，但其在操作上的灵敏度要求极高，因此其应用受到了限制。1.2共显性遗传收稿日期：2

8、006－03－17微卫星标记的等位基因遵循孟德尔遗传规律，作者简介：尚邦华（1978－），男，湖北石首人，在读硕士研究生。研究方向：动物分子遗传育种。呈共显性遗传，虽然RAPD技术也遵循孟德尔遗传107989766/7989866/7989877-0431/电话2006.05◢吉林畜牧兽医专论综述规律，但不能区分扩增出来的DNA片段是纯合的2.2鉴定亲缘关系还是杂合的。另外，微卫星标记变异程度高，等位在育种实践过程中，随着对动物个体及其产基因数多，且分布在整个基因组，因此在比较群体