crystalmaker教程

crystalmaker教程

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1、目录概述2Graphicswindow绘图窗口2ToolsPalette工具面板2Sidebar侧边栏3OverviewWindow观察视图窗口3菜单详细介绍3Ⅰ.FILE子菜单3Ⅱ.Edit子菜单16Ⅲ.Selection子菜单18Ⅳ.model子菜单23Ⅴ.Rendering渲染子菜单29Ⅵ.transform子菜单33Ⅶ.Window子菜单40Ⅷ.Help子菜单46Toolspalette详细介绍48操作工具48选择工具49测量工具50屏幕尺寸工具52缩放工具53旋转工具53旋转模式工具53Overview详细

2、介绍55Views55History56Files56Log57旋转58结构旋转(RotatiingtheStructure)58旋转面板(RotationPad)58旋转坐标系(Rotateaboutascreenaxies)59自动旋转59用鼠标进行旋转操作60概述Graphicswindow绘图窗口包括应用菜单,菜单介绍:File打开、创建、保存和关闭文件。输出相关的文本和图片Edit编辑文本、结构和化学键;拷贝图片到剪切板,或者取消上步操作Selection选择原子相关的操作,例如标注、显示、隐藏原子Mode

3、l选择结构模型显示的形式Rendering对模型的显示进行不同的设置Transform旋转、测量图片命令。可以测量化学键角度,或者产生粉末/单晶衍射花样Window对Crystalmaker操作界面进行设置Help提供在线帮助和用户手册ToolsPalette工具面板工具面板中的屏幕工具,可以操作、测量和编辑结构。测量工具加上旋转工具,可以对晶体进行精确位向操作。用户可以在键盘上输入相应的字母来选择工具。在工具面板的最上面,会显示晶体结构或单分子的彩色图片:这是显示是否在分子模式的快捷方法。分子模式用来描述原子团以及

4、其它没有长程对称的结构。Sidebar侧边栏包括SiteBrowser位置浏览器和Notespane注释界面:Sitebrowser提供关于结构中原子的信息。可以按照元素、位置标注对列表进行重新排列、同时在SiteBrowser中,可以对原子的颜色、可见度、标注以及半径进行编辑,并对单个位置或者同元素的原子簇进行编辑。在Notespane中,可以保存关于结构的文本信息。可以通过拖动Sidebrowser和Notespane之间的分隔栏来显示/隐藏二者。OverviewWindow观察视图窗口OverviewWindo

5、w提供关于复杂结构的动画和视频制作、文件浏览以及结构输出的具体细节等信息,由Views,History,file和Log四部分构成。菜单详细介绍Ⅰ.FILE子菜单一.File—>NewCrystal新建晶体出现以下EditCrystal对话框:此窗口由三部分组成:一、对称数据;二、晶格参数;三、非对称基元中原子列表。1.空间群符号用户可以直接输入空间群,或者点击Browse,然后选择一个空间群。空间群符号可以以一下三种格式输入:(1)国际符号必须输入正确的格式,字符之间要有空格(例如C2/c应该输入“C2/c”)。可

6、以使用简写的国际符号(例如“C2/c”),或者使用完整的国际符号(“C12/c1”)。完整的符号可以进行非传统的对称设置。(2)Schoenflies符号必须使用括号,符号间不能有空格。列入C62h应该输做:C2h(6)。(3)空间群号在晶体学国际表中。Crystalmaker假定为空间群的标准设置。230种空间群都包含在程序中。如果用户的输入不能被Crystamaker识别,警告三角号会出现。空间群浏览器在空间群浏览器中,用户可以从列表中选择一个空间群。在EditCrystal中点击Browse,或者选择Windo

7、w>Palettes>SpacegroupBrowser命令,就可以显示SpacegroupBrowser。SpacegroupBrowser的上部为搜索界面,下面为晶系、点阵类型和空间群的列表,显示了空间群的一些信息。搜索空间群:(1)在SpacegroupBrowser的上部搜索空格中输入空间群符号;(2)按回车键。如果搜索到空间群,其相应的晶系、点阵类型和符号就会加亮,相关信息就会出现在窗口的下面。显示非传统空间群:选择ShowAllSettings显示各种非传统空间群。.2.设定对称性(高级对称选项)编辑晶体

8、的第一步是以空间群的形式设置它的对称性。用户有时定义对称性需要更大的灵活性:也许在使用一种非传统的空间群设置,或者想要手动输入对称性位置。这种情况下,可以点击EditCrystal中的Options选项,出现SymmetryOptions对话框:单选按钮:①空间群在这种情况下生成一般等价位置(GEPs);限定晶格常数选项如果选择了Constra

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