临床基因诊断进展_陈鸣

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1、临床分子生物学诊断进展陈鸣教授主任医师第三军医大学第三附属医院检验科023-68757601,chenming1971@yahoo.comOUTLINE测序技术乙肝病毒耐药突变检测预测某些疾病的遗传风险程度肿瘤化疗药物敏感试验生物芯片技术固相芯片液相芯片基因组和分子检测:生物芯片技术DNA芯片cDNA芯片Oligo芯片信息生物芯片多肽芯片生物芯片微流体芯片功能生物芯片芯片实验室组织芯片蛋白芯片抗体芯片蛋白质芯片SAGE/CAGEepigenetics芯片质粒microarray微株array基因组genetics转录组mRNAIntrodu

2、ction“Science”:Foder提出基因芯片概念1991第一张基因芯片:美国Affymetrix公司1992第一张以玻璃为载体的基因芯片:Stanford大学P.Brown实验室,1995“Science”:Schena基因表达谱的研究,1995第一张实用型基因芯片:Affymetrix1996中国科学界第一次专项讨论:第80次“香山科学会议”上,1997年9月1998年度自然科学领域十大进展之一美国正式启动基因芯片计划:1998“生物芯片技术”正式列入国家“863”计划:1999SampleDNAEachspotcontainsk

3、nownDNABiochipComplementaryDNAhybridizeSignalappearsBiochipBasedonHybridization7我国残疾人口有8296万,其中耳聋残疾人群占2004万,占24%,累及2.6亿家庭人口。耳聋人群2006年第二次全国残疾人抽样调查数据8耳聋非综合征型耳聋(70%)遗传因素(约60%)常染色体隐性(80%)环境因素(约40%)综合征型耳聋(30%)Alport综合征Pendred综合征Waardenburg综合征BOR综合征Usher综合征细菌感染病毒感染耳毒性药物声损伤……常染色体

4、显性(15%)X—连锁(1%~3%)线粒体﹙<1%﹚耳聋的致病因素9中国人群遗传性耳聋的特点遗传性耳聋突变位点具有明显的种族差异中国人群大部分遗传性耳聋由4个基因的突变所引起:GJB2、GJB3、SLC26A4(PDS)、mtDNA12srRNA等中国人群的耳聋突变热点:GJB2:35delG,176del16,235delG,299delATSLC26A4(PDS):IVS7-2A>G,2168A>GGJB3:538C>T线粒体:12SrRNA:1555A>G,1494C>T10基因型与临床表型的对应关系线粒体基因C1494T、A1555

5、G突变:——氨基糖甙类药物敏感性耳聋GJB2基因:——先天性重度以上感音神经性耳聋PDS基因:——大前庭导水管综合征(EVAS)一种内耳畸形,先天或后天重度以上感音神经性耳聋GJB3:——后天高频感音神经性耳聋11遗传性耳聋的遗传特点父母均为健康携带者12耳聋基因检测的价值耳聋父亲耳聋母亲子女100%发病尽量避免两个同一基因纯合突变的聋人结婚!针对聋人群体:13耳聋基因检测的价值耳聋父亲耳聋母亲子女正常携带者100%基因检测可指导聋人的婚配,避免婚后再生聋儿!针对聋人群体:14基因在NSHL中所占比例突变热点主要人群比例GJB2~40%35

6、delGCaucasoid50-70%176del16Asiannodata235delGChinese>80%299delATAsiannodataGJB3nodata538C>TChinesenodataPDS~40%IVS7-2A>GChinese>50%2168A>GChinese>10%Japanese>50%12SrRNAnodata1555A>GChinese>7%1494C>TChinesenodata现有位点可覆盖中国人群中98%GJB2,80%PDS,90%药物性耳聋患者遗传性耳聋检测试剂盒包括的基因位点晶芯®遗传性耳聋

7、基因检测试剂盒标本采集3管EDTA抗凝的紫头管(最好空腹)16遗传性耳聋检测芯片的检测结果235杂合1555均质IVS杂合2168和IVS复合杂合2168纯合WildTypeControlWildtypeMutation可对四个基因9个位点的基因型进行准确检测,报告野生、杂合突变或纯合突变等三种结果QCBCPCPCNCQC35WIC35538W35MICG3538M176W1494WPC176M1494MBC235W1555W2168W235M1555M2168M299WICmtIVSW299MIC21IVSMICG2BCICIVS检测意义

8、GJB2基因——先天性耳聋基因:当GJB2基因发生突变时,患者出生即表现出耳聋症状检测意义:为耳聋患者确诊病因;指导生育有聋儿的家庭再次生育;筛查有耳聋家族史的家庭成员的基因突变

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