电泳胶片分析

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1、第七章電泳膠片分析VectorNTI可以將使用者的基因序列放在一個模擬的膠片屮，並且模擬電泳圖分析的結果。點選選項後會山現下列視窗（圖7.1）：圖7.1模擬電泳圖分析設定81GC人*¥丄yy丄丄丄'A3丄yy丄丄丄I丄＞此視窗中使用者可以設定電泳的條件，例如電泳片的大小、種類、電壓、緩衝液等；在左下角的ViewParameters選項可以設定電泳運作的時間。設定好之後按0K就可以進入以下畫面：圖7.2設定完電泳條件，會得到左邊視窗的樣子右邊的視窗是使用者的電泳膠片，左邊的視窗會有詳細的文字敘述。使用者slHI點選〜選項就可以選擇Marker（圖

2、7.3）圖7.3選擇所要製作的膠片ChooseDatabaseGelMarker?XNameShortestFraa..・LonaestFraa..・IM1KbDNAExtensionLad…50640000®123bpDNALadder1234182回25DbpDNALadder2503500®500bpDNALadder5008500回AD2_MARKER173935937回E・GelHighRangeDNAL..40010000®E-GelLowRangeQuanti...mii:»Lr»ii」」八100HCCC2000HCCCCVII

3、011Lookin:圉GelMaik來〔MAIN]▼]GelMarkerName:1KbDNAExtensionLadderOKCancel按下0K後marker就可以加入右邊的膠片中（圖7.4）:圖7.4加入膠片之後的結果，呈現在右邊視窗ActivePaneGeneralDescnptionConstantfieldBectrophaesisnAgaroseGe'Concentrafion:1.0%Votage:2.5V/cmLengthofGd:IScmBuffer:TAESeparationDistance:0.10ctTimeIncre

4、nent:15.0minAnimatonSpeed:5.0mr.^ec接著加入使用者的樣品，只要點選選項即可:*]2]!•1KbDNAExtensionLadder(15fragments)o圖7.5加入使用者樣品3・GeneralDescripbonConstantFeldEectroohaesisinAgaroseGdConcentraoon：1.0%Vtftaoe：2.5V/OTLengthofGd:15cmBuffer：TAESeparazonXxarce:0.10cnTmeInherent:15.0mrArrnaborSoeed:5.

5、0mn/secb_

6、1.1KbDMAExtensionladder(15fragment*此設定視窗（圖7.5）和上一章所提到的RFLP設定完全相同，使用者只要選取資料庫中的基因序列及限制酶後，再按下AddtoGel就可以加入膠片中了：圖7.6加入斑馬魚海大基因膠片日日GeneralDescriptionConstantFieldElectrophoresisinAgaroseGelConcentration:1.0%Voltage:2.5V/cmLengthofGel:15cmBuffer:TAESeparationDstance:0.10c

7、mCreateGelSampleiAddtoGeliAddtoGelSampleListTimeIncrement:15.0minAnimationSpeed:5.0mir/sec0Q1.1KbDNAExtensionLadder(15fragmS2]2.NONAME2(1fragments)±1[2]3.NONAME3(1fragments)®Q4.NONAME4(5fragments)S2]5.NONAME5(5fragments)0O6.NONAME6(20fragments)SourceMoleculesSubset:Molecules

8、:斑馬魚海大基因123456——■ISelectedforGelSampleMolecules:SourceEnzymesSubset:SaveasGelMarkerIMAIN斑馬魚海大基因Enzymes:SimlSmalSmllSnaBISpHSrflS$e232lS$e8647lS$pD5lSsplEnzymes:(CheckforPartialDigestion)allAvQamHbvIzapelBBBs3200SelectAllUnselectAllISampleName:Description:“丨丨丨丨丨丨■此視窗（圖7.6）樣品和

9、限制酶一樣可以複選，使用者可以針對不同的需求進行調整，要放入膠屮的分析物只要按下AddtoGel，選取完所有的樣品後關閉此視窗就可以進行電泳分析，把游