PubMed资料库使用简介

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1、PubMed資料庫使用簡介PubMed資料庫使用簡介一、資料庫內容簡介PubMed為美國國家醫學圖書館的美國國家生技資訊中心(NCBI)所製作的生物醫學相關文獻的書目索引摘要資料庫，並提供部分免費及付費全文連結服務，需要收費的全文，讀者可自行與出版社接洽。較之於MEDLINE資料以生物醫學、生命科學、生化學、行為科學為主，PubMed資料庫範圍更涵蓋了如下內容：1.對於超出學科範圍(如：資訊科學、航太科學)的特定生命科學、醫學、化學相關之期刊文章都會收錄於本資料庫中；2.收錄即將出版的醫學論文；3.已由NLM審核通過

2、並已由PubMedCentral典藏的全文文獻亦收錄之。二、資料庫操作說明主畫面PartI(五)(六)(七)(五)(一)(二)(三)(四)10PubMed資料庫使用簡介主畫面PartII(八)(九)(十)茲分述其功能及使用方式如下：(一)選擇資料庫美國國家生技資訊中心(NCBI)製作了一系列的生物醫學資料庫如下：1.PubMed：生物醫學文獻書目索引摘要資料庫。2.Nucleotide：包含GenBank、RefSeq、PDB資料庫中的人類基因序列資料。3.Protein：整合了SwissProt、PIR、PRF、P

3、DB、GenBank及RefSeq資料庫中的資料，並可參照Taxonomy資料庫，瞭解特定種類的蛋白質的在資料庫中分類狀況的相關說明。4.Structure：分子構造資料庫。5.Genome：基因組合序列資料庫。6.PopSet：可查詢某族群的基因序列，瞭解該族群演進之相關資料。7.OMIM：遺傳學資料庫。8.Taxonomy：在NCBI基因資料庫中提及的微生物的核酸或蛋白質序列的分類狀況之相關說明。9.Books：收錄C.elegansII.、IntroductiontoGeneticAnalysis.7thed.

4、、ModernGeneticAnalysis.、MolecularBiologyoftheCell.3rded.、MolecularCellBiology.4thed.、Retroviruses.等六本書。10.ProbeSet：以檢索的方式使用基因學詮釋文獻資料庫。11.3DDomains：以3D方式呈現細胞結構。使用者可點選下拉式選單中欲檢索的資料庫名稱，此外，檢索欄上方的快速功能表中則選列了常用的資料庫，如：PubMed、Nucleotide、Protein、Genome、Structure(即3DDomain

5、s)、PopSet、Taxonomy、OMIM、Books。10PubMed資料庫使用簡介(二)、關於Entrez檢索系統Entrez是一Web-based檢索系統，用以檢索下圖所示各資料庫，只要從其中一個資料庫出發，可在檢索結果中進行相關資料庫的檢索。(三)、輔助說明PubMed資料庫中備有詳盡的資料庫線上操作求助訊息，包括：Help、FAQ、Tutorial以便使用者自學；另有網站資料、功能異動訊息以告知使用者應注意的事項。(四)、PubMed服務項目1.JournalBrowser：藉由此功能，可以從「題名」或

6、「ISSN」或是「Medline刊名縮寫」查詢期刊的出版資訊。如以刊名查詢「JournalofAmericanDentalAssociation」，可找到期刊的基本資訊如下：點選「pISSN」中的連結可連到出版社網站；點選「MEDLINEAbbr.」中的連結可找尋該PubMed收錄該期刊的文章索引。2.MeSH瀏覽：點選此功能後，在檢索欄位中輸入欲查詢的詞彙，可瀏覽PubMed資料庫中所使用控制詞彙，如查詢「cancer」，系統顯示畫面如下：10PubMed資料庫使用簡介abca.說明在PubMed中「cancer」

7、一詞將以「Neoplasms」取代。b.可展開Neoplasms詞彙所包含的更精細的主題概念，並可勾選欲使用的主題，以布林邏輯的方式(AND、OR、NOT)加入檢索。c.可直接將Neoplasms主題概念以布林邏輯的方式(AND、OR、NOT)加入檢索。3.檢索特定文獻使用欄位化的檢索方式，找尋特定刊名、卷期、作者、篇名的文獻資料。4.批次檢索文獻(BatchCitationMatcher)10PubMed資料庫使用簡介以指令式的方式檢索資料庫中共有幾篇相關的文獻，只要輸入刊名、年代、卷期、起始頁、作者名、關鍵詞其中

8、部分欄位資料即可。形式如下：Journal_Title

9、year

10、volume

11、first_page

12、AuthorName

13、Your_key

14、5.臨床病理資料(ClinicalQueries)本功能提供臨床病理資料之查詢，並依HaynesRB等專家所制訂的最佳化檢索策略之機制，使用者可先行選擇檢索方向，如：治療方式(Therapy)、診斷方式(