ACE基因的多态性.ppt

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1、实验1颊粘膜上皮细胞基因组DNA的抽提及ACE基因多态性分析一、实验目的掌握从微量来源的组织细胞中抽提基因组DNA掌握PCR技术原理了解基因多态性分析的方法。二、原理基因组DNA抽提碱裂解法抽提基因组DNA(本实验)用蛋白酶K和苯酚提取大分子DNA裂解-蛋白酶K-沉淀法快速提取DNAACE基因多态性分析PCR方法分析基因多态性真核生物基因组中非编码序列多于编码序列基因组编码序列非编码序列调控序列重复序列高重复序列(串联排列,大卫星、小卫星、微卫星)中重复序列(散在分布;部分编码;Alu家族)低重复序列或单拷贝Alu家族重复单位:300bp左右

2、;130+31+130bp具Alu酶切位点30-50万次功能:基因调控Alu元件的插入、删除和重组与许多先天性遗传疾病和癌症相关ACE基因多态性分析(血管紧张素转换酶,Angiotesinconvertingenzyme,ACE)基因诊断:利用现代分子生物学和分子遗传学的方法,从DNA、RNA水平检测基因的存在、结构异常和表达状态,从而对疾病做出诊断的方法。基因多态性:指在一随机婚配的群体中,染色体同一基因座位点上有两种或两种以上的基因型,它可决定人体对疾病的易感性、临床表现多样性和对药物治疗反应的差异性。理论基础ACE基因第16内含子存在一

3、段长度为287bp(Alu序列)的插入/缺失(I/D)多态性片段,I/D多态性与血液ACE水平有明确关系,DD型ACE水平最高,ID次之,II最低。左室肥大患者中DD型频率明显增高。实验原理以DNA为模板,ACE基因特异的引物序列位于287bp插入/缺失片段的两侧进行PCR扩增,故II型扩增片段长度约为490bp,DD型扩增片段长度约为190bp,ID型扩增片段为2个,分别为190bp和490bp。根据PCR扩增片段的大小可进行多态性分析。插入片段插入型缺失型490bp190bp操作步骤基因组DNA抽提PCR反应琼脂糖凝胶电泳检测1.基因组D

4、NA抽提溶液Ⅰ10ml漱口20秒收集漱口水;3000g×5min×RT,弃上清;溶液Ⅱ250ul重悬沉淀;3000g×1min,弃上清;溶液Ⅲ250ul重悬沉淀,振荡10秒;(变性)转至0.5ml离心管,99℃×5min;加溶液IV50ul振荡5秒;(中和)3000g×1min,上清转移至新0.5ml离心管,取5ul用于PCR.2.PCR反应取消毒的0.5ml离心管,加入下列成分:10×PCRBufferdNTP(2.5mMeach)mix:10μlTaqDNApolymeraseDNA模板5μl引物混合物(10μMeach)2μlddH2O

5、3μl总体系20μl扩增程序为:94℃变性30s,55℃复性30s,72℃延伸40s,共反应35个循环。琼脂糖电泳检测制备1%琼脂糖凝点样,电泳紫外灯下观察结果ACE基因多态性电泳图2k1k750bp500bp250bp100bp

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