利用SSR和SRAP标记分析香橙资源的遗传多样性-论文.pdf

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1、西南农业学报2014年27卷4期SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciencesV01.27NA4文章编号:1001—4829(2014)04—1678—04利用SSR和SRAP标记分析香橙资源的遗传多样性杨海健,周心智,谭平,张云贵,弓亚林,杨世勇,钟昭林(重庆市农业科学院果树研究所,重庆401329)摘要:香橙是我国原产珍贵柑檑资源,具有很大的开发利用价值。为了进一步保护和利用该类资源,通过2种分子标记研究了9个香橙资源的多样性,并比较了这两种标记在分析植物多态性上的差异。结果显示:两标记均显示出9个香橙之间均存在不同程度的差异,其中,3

2、号香橙和8号糖橙遗传距离最近,2号香橙和7号软枝香橙距离最远。分析显示,SRAP标记比SSR标记能够更容易、更快捷的获得大量的多态性分子标记,而如果这两种标记相结合,将能获得更全面的扩增信患和更准确的聚类结果。关键词:sSR;SRAP;香橙;遗传多样性中图分类号:S565.1文献标识码:AGeneticDiversityAnalysisofJunosbySRAPandSSRMarkersYANGHai-jian,ZHOUXin—zhi,TANPing‘,ZHANGYun—gui’,GONGYa—lin,YANGShi—yong,ZHONGZhao—lin(InstituteofP

3、omology,CbengqingAcademyofAculturalSciences,Chongqing401329,China)Abstract:C/trusjunoisakindofpreciousl"eSouro~whichoriginatesinChina,anditisofgreatvalueinitsapplication.Tofurtherprotectandutilizethisres0urce,weusedtwokindsofmolecularmarkerstostudytheninejunosresourcedivemity,andcomparedthedi

4、ferencesbe-twecnthetwomarkersonjunosgeneticdiversityanalysis.’I'

5、leresultsshowedthatthetwo删e玛werebethshowingvaryingdegreesofdiferencesbetweentheninesamples.Amongthem,thegeneticdistancebetweenthe3Idandthe8‘hjUSesisthenearest,whilethatbetweenthe2ndandthe7isthefarthest.SRAPis&rteasierandmoreefic

6、ientacce88toalargenumberofpolymorphicmarkersthanSSR.Ifthesetwomarkersarecombined.morecomprehensiveamplifiedinformationandmoreaccurateclusterresultwouldbeobtained.Keywords:C/tru.s如;Geneticdiversity;SRAP;ssR重庆及其周边地区是我国香橙资源的分布区之DNA含量要求低、操作简单、重复性好等优点,并且一,这些野生香橙资源由于未被及时开发而容易受已成熟的应用到包括柑橘在内的多种植物中【。到

7、人们忽视,进而遭到破坏。目前已有的研究显示,比较SSR和SRAP两种标记在研究香橙资源的遗传香橙是我国原产并具有较大发展潜力的砧木资多样性、评价遗传差异等工作中的优劣,可为今后该源l1J。因此,加大对香橙资源的保护和开发力度,砧木的分子辅助育种工作提供参考。有利于进一步研究它在柑橘砧木及未来其它未知方1材料与方法面的应用。分子标记具有不受环境条件约束、标记数量多、1.1试验材料遍及整个基因组和多态性高等许多优点,使得其在本实验材料为9个香橙资源,2013年5月于重遗传多样性研究中得到非常广泛的应用。SRAP庆农科院果树所资源圃(江津)采集。表1中带有(Sequence—relat

8、edamplifiedpolymorphism)和SSR编号的资源均为未命名的野生资源。(Simplesequencerepeat)标记均具有多态性丰富、对1.2试验方法采集9个香橙资源的叶片,冷藏并带回实验室收稿日期:2014—0l一12基金项目:重庆市公益类科研院所基本科研业务费专项做清洗处理。采用CTAB法小量提取样品的基因组(2012csts-jbky-O051Y));国家现代柑橘产业技术体系(CARS-27)DNA并检测浓度和质量。分别利用SRAP和SSR及国家科技支撑

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