菌落pcr资料66534

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1、菌落PCR资料66534菌落PCR资料.txt偶尔要回头看看,否则永远都在追寻,而不知道自己失去了什么。男人掏钱是恋人关系,女人掏钱是夫妻关系,男女抢着掏钱是朋友关系。男人爱用眼睛看女人,最易受美貌迷惑;女人爱用心看男人,最易受伤心折磨。菌落PCR资料.txt28生活是一位睿智的长者,生活是一位博学的老师,它常常春风化雨,润物无声地为我们指点迷津,给我们人生的启迪。不要吝惜自己的爱,敞开自己的胸怀,多多给予,你会发现,你也已经沐浴在了爱河里。菌落PCR(ColonyPCR)方法作者:未知来源:生物秀时间:2007-7-2

2、1菌落PCR(ColonyPCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。具体方法:1、PCR混合物的制备Taqbuffer(10×)20uldNTP(2.5mM)5ulPrimerForward(50mM)10ulPrimerReverse(50mM)10ulddH2O147ulTaq(2U/ul)8ultotal200ul将上述

3、溶液混匀,10ul每管分装于200ulPCR管中。2、常温下随机挑选转化板上的转化子,用灭菌的牙签或枪头挑取少量菌体,在LB琼脂糖平板上轻点,做一拷贝;然后将沾有菌体的牙签或枪头置于相应的装有PCR混合物的PCR管中洗涤数下(管子做好记号,如平板上点的是1#,则管子上也标1#,以便筛选到克隆后的扩到培养),盖紧管子。3、将混有菌体的PCR混合物置于PCR仪中,按常规条件扩增。电泳检测是否得到目的片断。如有则为阳性克隆。4、将已经接种有菌落的平板置37℃培养箱培养过夜,使菌落扩增;次日挑选阳性克隆做进一步筛选或培养。步骤2

4、也可以不点板,直接接种摇菌,如果早上做PCR的话,下午就可以提质粒,得到重组载体。注意事项:设计引物很关键。一般如果是定向克隆,用载体上的通用引物即可;如pET系列可用T7通用引物。如果是非定向克隆(如单酶切或平末端连接),一条引物用载体,一条引物用目的基因上的,这样就可以比较方便的鉴定了,而且错误概率很低。PCR条件的选择接近最佳,同时挑取的菌体不宜太多,否则会有非特异性扩增。ColonyPCRAmplifySSLPmarker(CER454202)from51MO5Agrostreaks.E.coli51M5stre

5、akusedaspositivecontrol.AgroandE.colistreakof79E22usedasnegativecontrol.1.Mix10μlNEBTaqbuffer+90μlH2O.Aliquot10μlofthemixintoPCRtubes.Labelwiththesamplename.ToucheachstreakwithtoothpickandtransfercellstothebufferinthePCRtubes.2.PreparePCRmixonice:________________

6、_________________________________________ForeachsampleyouneedFor8samplemix___________________________________________________________________17μlH2O17μlH2O4μlNEBTaqbuffer32μlNEBTaqbuffer5μl2.5mMdNTPs40μlmMdNTPs7μlCER454202Fprime(3μM)56μlCER454202Fprime(3μM)*7μlCE

7、R454202Rprime(3μM)56μlCER454202Rprime(3μM)**0.2μlTaqpolymerase(NEB)1.6μlTaqpolymerase(NEB)___________________________________________________________________Add38μlofthemixtoeachPCRtubeandmixgentlybypipetting.3.RunPCR:95℃5min95℃30sec,52℃30sec,72℃1min,40cycles72℃1

8、0min*2.1μlCER454202Fprime(3μM)16.8μlCER454202Fprime(3μM)**2.1μlCER454202Rprime(3μM)16.8μlCER454202Rprime(3μM)菌落PCR资料菌落PCR菌落PCR与我们通常的普通DNA的PCR的不同在于,直接以单个菌作为模板。是

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