代谢组学

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时间:2021-12-21

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1、代谢组学的研究体内药物分析2021/12/19代谢组学定义通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学。2021/12/19体内药物分析代谢组学是20世纪90年代中后期继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。之后得到迅速发展并渗透到多项领域。细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,如细胞信号释放,能量传递,细胞间通信等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢组(metabol

2、ome)——在某一时刻细胞内所有代谢物的集合——的一门学科。2021/12/19为什么要研究代谢组学呢?体内药物分析基本概念2021/12/19体内药物分析转录组学研究核糖核酸转录过程蛋白质组学研究生物系统表达的蛋白质及由外部刺激引起的差异基因组学研究生物系统的基因结构组成,即DNA的序列及表达代谢组学研究生物体系(细胞,组织或生物体)受外部刺激所产生的所有代谢产物的变化系统生物学基因组学DNAmRNA细胞蛋白质代谢物组织个体器官转录组学蛋白质组学代谢组学转录组基因组蛋白质组代谢组代谢组学研究目的代谢组学研究的目的是

3、定量分析一个生物系统内所有代谢物的含量。代谢组学分析可以指示细胞、组织或器官的生化状态,协助阐释新基因或未知功能基因的功能,并可以揭示生物各代谢网络间的关联性,帮助人们更系统地认识生物体。(举例)研究对象:作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)2021/12/19体内药物分析代谢组学的优点(与基因组学和蛋白质组学等其他组学相比)基因和蛋白表达的微小变化会在代谢物水平得到放大;代谢组学的研究不需进行全基因组测序或建立大量表达序列标签的数据库;代谢物的种类远少于基因和蛋白的数目,每个生

4、物体中代谢产物大约在10³数量级,而最小的细菌,其基因组中也有几千个基因;生物体液的代谢物分析可反映机体系统的生理和病理状态。2021/12/19体内药物分析代谢组学研究步骤样品采集和预处理提取灭活储存数据采集NMRMSGC-MSLC-MS数据预处理滤噪重叠峰解析峰对称峰匹配标准化归一化数据分析非监督学习方法有监督学习方法数据库专家系统体内药物分析2021/12/19途径分析标记物识别生物样品收集与预处理代谢组学研究常用的检测技术,一般不需要对标本特别分离、纯化等,但须立即阻断内在酶的活性,常用方法:冷冻/液氮降温法

5、冷冻、干燥细胞间仍始终有低水平的代谢活动,需尽量避免氧化等活化因素2021/12/19体内药物分析样品采集常有样品:生物体液

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