sars 冠状病毒n 基因的扩增与克隆

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1、栏  目:论著·基础研究SARS冠状病毒N基因的扩增与克隆作者:肖维威1;马文丽1;张宝1;王艳1;毛向明1;彭翼飞1;宋艳斌1;吴清华1;郑文岭2  (1第一军医大学分子生物学研究所,广东  广州  510515;2广州军区广州总医院分子肿瘤学研究所,广东  广州510010)摘要:目的  RT-PCR扩增、克隆SARS冠状病毒N蛋白基因。方法  根据GenBank数据库中TOR2株的全基因组序列,利用PrimerPremier5.0软件设计引物RT-PCR巢式扩增SARS冠状病毒的N基因,PCR产物克隆后进行测序鉴定。结果  序列分析表明,pMD18-T载体中已成功重组了N基因。结论  

2、N蛋白基因的扩增、克隆成功,为N蛋白的表达、N蛋白结构与功能的研究奠定了基础。关键词:严重急性呼吸综合征;N基因,冠状病毒;逆转录-聚合酶链反应中图分类号:Q786  文献标识码:A  文章编号:1000-2588(2004)01-0039-03AmplificationandcloningoftheNgeneofSARS-associatedcoronavirusXIAOWei-wei1;MAWen-li1;ZHANGBao1;WANGYan1;MAOXiang-ming1;PENGYi-fei1;SONGYan-bin1;WUQing-hua1;ZHENGWen-ling21Instit

3、uteofMolecularBiology,FirstMilitaryMedicalUniversity,Guangzhou510515,China;2InstituteofMolecularOncology,GuangzhouGeneralHospitalofGuangzhouCommand,Guangzhou510010,ChinaAbstract:Objective  ToamplifyandclonetheNgeneofsevereacuterespiratorysyndrome-associatedcoronavirus.MethodUsingprimerPremier5.0sof

4、tware,twopairsofnestedPCRprimersweredesignedtoamplifytheNgene.Afterpurification,theamplifiedproductswereclonedintopMD18-Tvectors,andthepositivecloneswiththeinsertedfragmentswereidentifiedbysequenceanalysis.Results  Theamplifiedproductswasabout1375bpinlength,andsequenceanalysisdemonstratedthattheNge

5、nefragmentshadbeensuccessfullyinsertedintopMD18-Tvectors.Conclusion  ThesuccessfulamplificationandcloningofNgenefacilitatesfurtherinvestigationoftheexpressionoftheNproteinandstudyofitsstructureandfunctions.Keywords:severeacuterespiratorysyndrome;SARS:N-gene,coronavirus;reversetranscription-polymera

6、sechainreaction收稿日期:2003-07-01作者介绍:肖维威(1974-),女,1998年毕业于第一军医大学,现为第一军医大学在读博士研究生,讲师,电话:020-61648114-89097通讯作者:马文丽,电话:020-61648210,E-mail:wenli@fimmu.comCorrespondingauthor:MAWen-li,E-mail:wenli@fimmu.com    2003年4月16日,WHO正式确认SARS冠状病毒是SARS感染的病原体。生物信息学分析和病毒学研究表明,SARS冠状病毒不属于任何已知的冠状病毒家系,是一类新型病毒[1][2]。SAR

7、S病毒颗粒周围环绕着象日冕一样的圆环,圆环之上和外壳表面分布着大大小小的蛋白。但对感染致病起重要作用的可能是6种关键蛋白:E蛋白、S蛋白、M蛋白、N蛋白、多聚酶和3CL蛋白水解酶[2][3]。本研究应用自行设计的巢式引物RT-PCR扩增了其中的N基因,并对N基因进行了克隆和鉴定,现将实验结果报告如下。    1  材料与方法    1.1  材料    样品取自北京SARS住院患者的痰液标本;受体菌TOP10

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