耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因多态性分型研究

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1、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因多态性分型研究【摘要】目的探索一种准确、快速、可靠的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子生物学分型方法，了解医院内MRSA的多态性，为临床合理、有效地使用抗生素和控制耐药基因在种群间的传播提供帮助。方法用MecA基因相关高变区PCR扩增(HVR-PCR)和随机扩增多态性DNA(RAPD)两种方法，对MRSA菌株进行多态性分析。HVR-PCR检测MecA基因相关高变区正相重复序列元件(DRUs)的长度，根据DRUs数目的不同对MRSA分型;RAPD根据电泳图谱中条带的数目及位置，经NTSYS统计软件进行聚类分析，得到遗传树状图，按MRSA菌株之间的相关性进行分

2、型。结果应用HVR-PCR方法可将31株MRSA标本分为7型，分别含有7、8、9、10、11、12和16个DRUs，其中10DRUs型最多/[11/31(%)/]，16DRUs型最少/[1/31(%)/];应用RAPD分型,31株MRSA共分10型，其中以IV型为主/[10/31(%)/]，其他型分布比较接近。在11株HVR-PCR分型的10DRUs型中RAPDIV型4株/[4/11(%)/]，RAPDII1型和RAPDIV型各2株/[2/11(%)/];10株RAPDIV型中9DRUs型、1ODRUs型各4株/[4/10(%)/]。结论RAPD方法和HVR-PCR方法对MRSA的分型率都比较

3、高，而且这两种方法都比较简单、稳定、可靠、快速，实用性强，具有广阔的应用前景。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因多态性分型研究【摘要】目的探索一种准确、快速、可靠的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子生物学分型方法，了解医院内MRSA的多态性，为临床合理、有效地使用抗生素和控制耐药基因在种群间的传播提供帮助。方法用MecA基因相关高变区PCR扩增(HVR-PCR)和随机扩增多态性DNA(RAPD)两种方法，对MRSA菌株进行多态性分析。HVR-PCR检测MecA基因相关高变区正相重复序列元件(DRUs)的长度，根据DRUs数目的不同对MRSA分型;RAPD根据电泳图谱中条带的数目及位置，经N

4、TSYS统计软件进行聚类分析，得到遗传树状图，按MRSA菌株之间的相关性进行分型。结果应用HVR-PCR方法可将31株MRSA标本分为7型，分别含有7、8、9、10、11、12和16个DRUs，其中10DRUs型最多/[11/31(%)/]，16DRUs型最少/[1/31(%)/];应用RAPD分型,31株MRSA共分10型，其中以IV型为主/[10/31(%)/]，其他型分布比较接近。在11株HVR-PCR分型的10DRUs型中RAPDIV型4株/[4/11(%)/]，RAPDII1型和RAPDIV型各2株/[2/11(%)/];10株RAPDIV型中9DRUs型、1ODRUs型各4株/[4

5、/10(%)/]。结论RAPD方法和HVR-PCR方法对MRSA的分型率都比较高，而且这两种方法都比较简单、稳定、可靠、快速，实用性强，具有广阔的应用前景。【关键词】耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;MecA基因；随机扩增多态性DNA:MecA基因相关高变区PCR扩增ABSTRACT:ObjectiveToinvestigatethepolymorphismsofmethicillin-resistantStaphylococcusaureus(MRSA)inlocalhospitalsinordertoprovideevidenceforclinicaldoctorstousetheantibiot

6、icsrationallyandanalyzedthepolymorphismsofMRSAwiththemethodsofPCRformec-associatedhypervariableregion(HVR-PCR)andrandomamplifiedpolymorphicDNA(RAPD).MRSAstrainstypedbyHVR-PCRaccordingtothelengthpolymorphismswhichdecidedbythenumberofdirectrepeatunitelements(DRUs)ofHVR-PCRproducts;GroupingofMRSAbyRAPD

7、wasbasedonthedependabilityamongdifferentMRSA31MRSAstrainstypedbyHVR-PCRweredividedinto7typeswhichcontained7,8,9,10,11,12andl6DRUs.MRSAstrainswithlODRUsweremostpredominant,presentinl1/3leases(%).Amongt