多重耐药大肠埃希菌基因分型及其与耐药表型的关系

多重耐药大肠埃希菌基因分型及其与耐药表型的关系

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1、多重耐药大肠埃希菌基因分型及其与耐药表型的关系:李彬,黄心宏,傅蔷,曹颖平,潘玉红【摘要】目的分析福州地区临床分离的多重耐药大肠埃希菌的基因型及其与细菌耐药表型的关系。方法收集临床分离的多重耐药大肠埃希菌88株,采用KB法进行药敏试验,多重PCR法进行基因分型。结果多重PCR法可将大肠埃希菌分为4个基因型,其中检出D型42株,B2型17株,A型17株,B1型12株。4组基因型对阿米卡星、头孢他啶、头孢曲松、头孢噻肟和妥布霉素的耐药率差别有统计学意义(P<0.05)。结论多重耐药大肠埃希菌对多种抗生素具

2、有很高的耐药性。基因分型以致病性较强的B2型与D型为主,应采取相应措施预防院内感染。【关键词】大肠杆菌O157;药物耐受性;聚合酶链反应;基因型;序列分析大肠埃希菌是医院感染最常见的革兰阴性条件致病菌,可在医院环境中长期存在,尤其当患者免疫力低下时,常引起泌尿系统、下呼吸道、胃肠道、手术切口及烧伤感染和菌血症,病死率高。近年来医院获得性感染的发病率逐年上升,且由于抗生素的不合理应用和耐药基因的广泛播散,大肠埃希菌对抗生素的耐药问题日益突出,多重耐药临床分离株愈发常见。笔者对临床分离多重耐药大肠埃希菌进行遗传分

3、型,以期获得流行病学资料,便于进一步研究。  1材料与方法  1.1菌株收集检验科2008年8月-2009年2月临床分离的多重耐药大肠埃希菌共88株,标本包括痰、尿液、胆汁、创面分泌物、血液等。多重耐药菌定义为对任何不同三种类型以上抗生素耐药的临床分离株[1]。  1.2仪器及试剂常规药敏纸片氨苄西林每片10μg、氨苄西林/舒巴坦每片20μg、阿米卡星每片30μg、环丙沙星每片5μg、左氧氟沙星每片5μg、亚胺培南每片10μg、复方新诺明每片25μg、妥布霉素每片10μg、哌拉西林/他唑巴坦每片100μg/1

4、0μg、头孢唑啉每片30μg、头孢呋辛每片30μg、头孢曲松每片30μg、头孢他啶每片30μg、头孢噻肟每片30μg、头孢吡肟每片30μg、头孢噻肟/克拉维酸每片30μg/10μg、头孢他啶/克拉维酸每片30μg/10μg均购自英国Oxid公司;基因分型引物、dNTPMix(10mmol/L)、Taq酶、琼脂糖、LoadingBuffer(6×)、Marker(100~600bp)均购自上海生工生物工程技术服务有限公司。MH琼脂、伊红美蓝琼脂均购自杭州天和微生物试剂有限公司。PCR扩增仪(美国BIORAD公

5、司);全自动细菌鉴定仪(VITEK60型,法国梅里埃公司)。  1.3质量控制质控菌株为卫生部临检中心的大肠埃希菌ATCC25922。  1.4方法  1.4.1菌株鉴定采用全自动细菌鉴定仪鉴定菌株。  1.4.2药敏试验采用KB法,判断结果参考美国临床和实验室标准协会CLSI标准[2]。  1.4.3多重PCR引物参照文献[3]煮沸法提取细菌DNA作为模板进行扩增。反应体系为总体积20μL,引物各为1μmol/L,dNTPMix200μmol/L,Taq酶2.5U,模板2μL。循环参数为94℃5min→

6、94℃30s→55℃30s→72℃30s,共30个循环,最后1次延伸时间为7min。引物序列及产物长度见表1。扩增产物用2%琼脂糖凝胶电泳后观察结果。表1多重PCR引物序列  1.4.4基因分型根据多重PCR扩增产物的电泳结果,按照图1进行分型[3]:  chuA、yjaA和TspE4.C2为多重PCR检测的目标基因;A、B1、B2和D分别表示大肠埃希菌的四个基因型.  1.5统计学处理、采用WHONET4.0软件分析数据。根据遗传分型结果分为A、B1、B2、D四组,采用行列表资料的χ2检验对药敏结果的数据进

7、行分析,P<0.05为差别有统计学意义。  2.3不同基因分型的药敏情况将88株多重耐药大肠埃希菌以不同基因型分为A、B1、B2、D4组,并对其对15种抗生素的耐药情况进行统计分析发现,4组对阿米卡星、头孢他啶、头孢曲松、头孢噻肟和妥布霉素的耐药率差别有统计学意义(P<0.05)。A和B2型对阿米卡星的耐药率为0,较B1和D更为敏感;B2和D型对头孢他啶和头孢曲松的敏感性不如A和B1型;D型对头孢噻肟最为敏感,B2对妥布霉素最敏感(表3)。表3不同基因分型对药物耐药率比较  3讨论  笔者采用文献

8、[3]方法对大肠埃希菌进行快速分型。该法快速、高效、准确,可在很短的时间内将大肠埃希菌分为4种主要的亲缘群体,分别是A、B1、B2以及D型。Clermont等在对230株大肠埃希菌进行基因分型时发现该菌主要为B2型,其致病性最强;其次为D型的致病性稍弱;而体内共生的大肠埃希菌主要是A型[3]。本组多重耐药大肠埃希菌中B2型占19.32%;D型检出比例更高,占47.72%,表明在多重耐药的大肠埃希菌中

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