甘薯冷诱导转录组测序及转录因子swdreb1b在抗冷调节中的作用

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1、‘'.社分类号_型_密级不保密UDC633全曰制硕王专业学位研究生学位论文甘馨冷诱导转录组测序及转录因子SwDREBlB在抗冷调节中的作用作者姓名:赵晓飞指导教师:杨虎清副教授专业学位名称;农业推广硕±领域名称:食品加工与安全研究方向:农产品胆藏与保鲜所在学院:农业与食品科学学院论巧日期:2015年12月21日浙江农林大学2015年12月独创性声明本人声明,所呈交的学位论文,是受浙江省自然科学基金项目(Y14C200052)""SCBF的,甘墓冷诱导转录因子p抗冷

2、特性研究资助,在指导教师指导下通过我的努力取得的成果,并且是自己撰写的。尽我所知,除了文中作了标注和致谢中己经作了答谢的地方外,论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果,也不包含在浙江一农林大学或其他教育机构获得学位或证书而使用过的材料。与我同对本研究做出贡献的同志,都在论文中作了明确的说明并表示了谢意。如被查有严重侵犯他人知识产权的行为,由本人承担应有的责任。学位论文作者亲笔签名:义日期:V皮辜P.W论文使用授权的说明本人完全了解浙江农林大学有关保留、使用学位论文的规定,即学校有权送交论文的复印件,允许论文被

3、查阅和借阅;学校可公布论文的全部或部分内容,可W采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。保密,在__年后解密可适用本授权书。□不保密,本学位论文属"于不"保密。0(请在方框内打V)学位论文作者亲笔签名:曰期:来主巧_指导教师亲笔签名:卸考曰期:風。’2//ZhejiangA&FUniversityDissertationfortheDegreeofMasterTranscriptomeanalysisUnderColdStressandFunctionidentificationofSwDREB1Bincoldin

4、ductionfromsweetpotato(Ipomoeabataasa)Candidate:ZhaoXiao-feiAdviser:YangHu-qingAssociateprofessorSpecialty:FoodProcessandSecurityDateofSubmission:December21,2015ZhejiangA&FUniversityLin’an,zhejiangprovince,P.R.ChinaDecember,2015摘要摘要甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Lam.)作为世界上第4大粮食作物,除了食用外

5、,还是重要的工业原料。甘薯喜温怕冷,在贮藏过程中极易发生冷害。然而目前对甘薯冷害在分子水平的研究鲜有报道。本研究利用转录组测序技术获得了块根在低温胁迫下的表达数据谱并对筛选出的甘薯DREB(SwDREB)家族基因进行了克隆、表达以及与抗氧化酶活性间的相关性做了研究,主要研究结果如下:(1)测序产生了8.25Gb的高质量数据,40.86Mb的cleanreads。组装拼接后共获得201,388条Transcripts和60,170条Unigenes;N50分别为2035bp、1455bp;平均长度分别为1352.32bp、781.90bp。(2)通

6、过与不同数据库比对,共有34,168条Unigenes获得了注释信息,其中注释到GO数据的有22,723条,7,437条Unigenes注释到148条KEGG途径。有16条Unigenes被注释到DREB家族。26,002条Unigenes未获得注释,这其中可能有部分属于甘薯特有基因。(3)低温胁迫下,实验组与对照组相比,共有4,470条差异表达基因,其中上条表达的Unigene有4,059条,下调表达的有411条。(4)利用PCR技术克隆得到了两条DREB基因:SwDREB1B、SwDREB2。SwDREB1B的ORF全长为711bp,编码23

7、7个氨基酸,无内含子,含有一个AP2结构域,氨基酸序列比对和系统进化树分析该基因属于DREB1类成员。SwDREB2基因ORF全长726bp,含有一个AP2结合域,含有典型的YRG和RAYD保守区,序列比对和系统进化树分析该基因属于DREB2类。(5)利用qRT-PCR对SwDREB1B基因的组织特异性及低温逆境诱导表达进行分析,结果表明:SwDREB1B在甘薯中均有表达,不具有组织特异性;低温诱导上调表达;SwDREB1B在低温下的表达与多种抗氧化酶的活性呈正相关;在叶片和块根中,CuZnSOD、APX、β-淀粉酶受低温诱导表达,而CAT只在块

8、根中被诱导。关键词:甘薯;转录组测序;DREB/CBF转录因子;低温胁迫;抗氧化酶IABSTRACTABSTRACTSweetpotat

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