鸭疫里默氏菌ragb基因的生物信息学分析和克隆表达

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3、独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外成果。尽我所知，学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研巧成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已。与我在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：运裳么ｗｆ年月曰／ｒ；＾＾关于论文使用授巧的声明，目本人完全了解四川农业大学有关保留：学校有权、使用学位论文的规定Ｐ保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可采

4、用影印。、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文同意四川农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表。、传播学位论文的全部或部分内容＾＾。□，在年解密后适用本授权。＾本论文不保密本论文保密＿＂＂（请在切上□内划Ｖ）研究生签名：运吳山年《月／ｒ日；／ｒ＾．日导师签名：年月四川农业大学硕丄？学位论文中文摘要化ＲＡ一鸭疫里默氏菌（ｅｗｅｒｅ化ｒａｎ邮ｅｓ／诉ｒ，）是种能引起鸭、聽、火鸡等多种禽类发生急性或者慢性败血性经过的接触性传染病的感染病原。该病是目前阻碍养鸭业一生产的重要疾病之。本研究通过生物信息学分析血清１型ＲＡ基因组序列比对出－ＲＡ

5、ＣＨ１Ｂ公（ＧｅｎｂａｎｋＰ．１株的受体抗原蛋白基因ｒａｇ登录号：Ｃ００３７８７），选择－３２ａ＋ｐＥＴ原核表达载体对该基因进行克隆表适，主要结果如下：（）１ＲＡｒａ处基因的生物信息学分析〇一ＲＡｒａ各公基因全长１５９３ｂｐ，Ｇ＋Ｃ含量为３５．７２／〇。该基因含有个ＯＲＦ，良ＰＯＲＦ１５９３。密码子有效数（ｅｆｆｅｃｔｉｖｅｎｕｍｂｅｒｏｆｃｏｄｏｎｓ，ＥＮＣ）为３８．４９１，稀有密码子个数为４３，含有３个密码子二联体（ＡＧＡＡＴＡ、ＡＧＡＡＧＡ、ＡＴＡＡＴＡ）但不含有连续的２个Ｗ上的稀有密码子串。密码子偏爱性分析结果显示该基因的偏嗜密码

6、子中，其第Ｈ位碱基大多为Ｔ碱基（８个）或者Ａ碱基（口个）。ＲＡ巧姆基因有２５个密码子的使用频率与大肠杆菌的密码子使用频率具有盈著差异；有２６个密码子与酵母菌密码子使用频率具有显著差异；有３０个密码子与人的密码子使用频率具有显著差异。所Ｗ优先选择大肠杆菌原核表达系统作为ＲＡＲａＢ蛋白的异源表达系统。ｇＲＡＲａｇＢ蛋白由ＷＯ个氨基酸编码大小为５８．９７ｋＤａ的蛋白，等电点（ｐｉ）为５．７１６。？？该蛋白有信号狀切割位点，没有跨膜区，抗原表位主要集中在６０７７、１８６２０１、？？－２５？Ｎ１２６９、３８７４０３、４９５５１３位氨基酸：２。蛋白功能位点预测有

7、糖基化位点个０）（１１０１４７２７３４７４）６、４５０，蛋白激酶Ｃ憐酸化位点５个、、、３０３、，酪蛋白激２０－２酶ＩＩ磯酸化位点３个（、３７３、３９９），Ｎ豆疆醜化位点９个（５６、７３、３１９、３８、３３４、３９３、４４５、４７３、４９６），酪氨酸激酶憐酸化位点２个（２巧、４３８），ｃＡＭＰ和ｃＧＭＰ依赖性位点１个（２５５）。亚细胞定位分析该蛋白主要分布于细胞膜上。氨基酸进化树分析表明该蛋白与黄杆菌科编码民ａｇＢ蛋白的其它成员相似性较低。２Ｒ