大豆总RNA提取方法比较及其在基因克隆和表达分析中的应用-论文.pdf

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1、分子植物育种,2013年,第l1卷,第2期,第255—261页MolecularPlantBreeding,2013,Vo1.11,No.2,255—261技术主题TechnologyFeature大豆总RNA提取方法比较及其在基因克隆和表达分析中的应用郭彬,2侯思宇·黄可盛t,2路阳1韩渊怀1王玉国2’1山西农业大学生物工程研究所,太谷,030801;2山西农业大学农学院,太谷,030801。通讯作者,tgwygn@126.corn摘要为确立大豆叶、花组织提取总RNA的最佳方法,比较了植物总RNA提取试盒剂法、改良的CTAB.LiCL法和改良的热硼酸

2、法的提取效果。通过RNA产量、纯度、凝胶电泳及后续的基因克隆和荧光定量PCR等分析,结果表明:热硼酸法所提取的叶、花总RNA含量约为其他两种方法的6倍;总RNAODOD28o值介于1.98—2.1;电泳条带完整清晰;应用获得的总RNA所克隆ZAT9一like基因,经测序获得885bp的核酸序列与ZAT9-1ike(登录号:XM003517371.1)基因同源率达99%;荧光定量分析HistoneH3基因的扩增曲线与融解曲线峰型良好。说明该方法能够满足一般分子生物学下游实验的要求,是一种理想的针对大豆叶、花总RNA的的提取方法。关键词大豆,总RNA,热硼

3、酸法DifferentMethodsforExtractingTotalRNAandTheirApplicationinGeneCloningandGeneExpressionAnalysisinSoybean(Ginemax)GuoBin工HouSiyuHuangKeshengLuYangHanYuanhuaiWangYuguo’1InstituteofAgriculturalBioengineedngs,Taigu,030801;2SchoolofAgriculture,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu,0308

4、01Correspondingauthor,tgwygn@126.cornDOI:10.3969/mpb.011.000255AbstractInordertofindouttheoptimalmethodforextractingtotalRNAfromleavesandflowersinsoybean(Gfyc船,扎),extractingeficiencywascomparedamongthreemethodsofRNAextraction,RNApureplantkit,modifiedCTABandhotborate.Theyieldandp

5、urityoftotalRNAweredeterminedbynucleicacidandproteindetector;integrityandqualityoftotalRNAwereanalyzedbyagrosegelelectrophoresis,genecloningandreal—timePCR.刀leresultsshowedthattheyieldoftotalRNAbyusinghotboratewassixtimesthatbytheothermethods(RNApureplantkitandmodifledCTAB).Thev

6、alueofOD~/OD2帅wasbetween1.98to2.01;Theelectr·ophoresisresultofRNAshowedsatisfactorybandswithsharpnessandintegrity.ZAT9一likegenewasobtainedbycloningfromthetotalRNA,sequencedtothenucleicacidsequenceof885bp,showingupto99%homologytoZAT9一likegene.Inreal-timePCRamplification,curvepeak

7、typeandthemeltingcurvepeaktypewerebetterwithRNAextractedwithhotboratethantheothermethods.ThequalityoftheRNAbyhotboratewasofhighqualityforgenecloning,real—timePCRandtheotherdownstreamapplicationinmolecularbiology.、KeywordsGlycine,懈,RNAextraction,Hotboratemethod提取植物组织中总RNA是对植物分子生物

8、学的建立以及转录组测序等后续试验。植物组织中所方面进行研究的必要手段。高质量的总RNA可进行含

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