硫普罗宁药物的葫芦脲包合物稳定性研究-论文.pdf

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1、第3l卷第6期计算机与应用化学Vo1.31,No.62014年6月28日ComputersandAppliedChemistryJune28,2014硫普罗宁药物的葫芦脲包合物稳定性研究刘立,李代禧,余华星,翟振,张燕,刘宝林(上海理工大学食品科学与工程研究所,上海,200093)摘要:近年来,随着超分子化学的迅猛发展,环糊精、葫芦脲等物质在药学方面的应用日趋受到关注。色谱技术的发展,也使得药物分子的分离纯化技术有了很大提升。本文利用分子动力学模拟和Gaussian量子化学计算,分析硫普罗宁对映

2、体的葫芦脲【](一7,8)包合物在常温下的动态结构稳定性和热力学稳定性,以期研究葫芦脲在亲和色谱分离时作为固定相的可能性。在真空条件下,通过分析包合物在常温时的动态结构、包合物的氢键作用和热力学分析结果可知,葫芦脲[n】=7,8)可以包合硫普罗宁对映体,2个硫普罗宁对映体.葫芦脲[7】包合物的稳定性高于2个硫普罗宁对映体.葫芦脲[8】包合物。因此,葫芦脲【7]可以用于亲和富集2个硫普罗宁对映体,但不能有效地拆分硫普罗宁对映体;而葫芦脲[8】对2个硫普罗宁对映体包合作用尽管稍小,但差异性非常明显,

3、故葫芦脲[8]有望作为1个有效的亲和色谱手性剂使用,用于拆分硫普罗宁对映体。关键词:葫芦脲:硫普罗宁;稳定性;分子动力学;热力学中图分类号:TQ015.9:TP391.9:06.39文献标识码:A文章编号:1001-4160(2014)06—760-762DoI:lO.11719/corn.app.chera20140626大空高环腔的化直刚径合性物大,一于其,端具疏I有水Zl直两空径端腔开,能呈包口葫合的芦空有状腔机【1药。】。其葫物端小芦脲分口尺子分寸子,相具形有成同萎较高,、?、.、\一/

4、>/\.Q,■:义/稳定性的包合物。因此,葫芦脲具有较高的热稳定性。A:RTP—CB[7】InclusionB:STP—CB[7]Inclusion硫普罗宁(Tiopronin,TPN)是1种新型含游离巯基的甘氨酸衍生物[2]。该药物的结构中含有1个手性中心,临一床上,以其外消旋混合物的形式给药『3J。由于游离活性巯一一基的存在,使得该药物具有保护肝细胞及促进肝细胞再生,消除自由基和解毒的作用,但其极易被氧化,故与c:RTP—CB[8]InclusionD:STP-CB[8】Inclusion氧

5、化性较强的药物作用时,易丧失药效【2】。由于手性药物Fig.1FourStructuresofTPN—CB[n】Inclusion(”=7,8).的对映体间立体构型的不同,疗效、毒性和药动学方面图l4种硫普罗宁对映体一葫芦脲【】(H=7,8)的包合结构也会表现出明显的立体选择性【9】。因此,本文拟通过分子本实验采用分子动力学计算和量子化学计算2种方模拟和量子化学计算的方法,研究不同葫芦脲的包合作法。在分子动力学计算阶段,利用Accelrys公司的用对硫普罗宁对映体的亲和分离和手性拆分的促进效Ma

6、terialStudio5.0l6软件进行分子动力学模拟。系统条件果。设定为恒温恒容的NvT系综,模拟温度采用Velocity—scaling控制方法,设定为300K,时间步长设定2计算方法为1fs,力场为pCfo范德华分子相互作用和库伦作用的本文选取葫芦脲[7]和葫芦脲[8]为主体结构,原始结截距均为1.25nm。体系结构优化后,进行1as的动力学构选自国际晶体学数据库中的三维晶体结构。利用DS模拟,每250步记录一次分子结构。ViewerPro6.0【4软件,分别构建客体R型硫普罗宁在量子化

7、学计算阶段,利用Gaussian09软件进行量(R-Tiopronin,RTP)、S型硫普罗宁(s.Tiopronin,STP)分子子化学计算。结合密度泛函理论的B3LYP方法,以6.31结构。利用ArgusLab4.0.1I5化学软件的Dock功能,分G基组水平进行优化计算。在相同的计算方法和基组水别构建硫普罗宁对映体和葫芦脲包合物的分子模型,如平下,对优化后的稳定包合结构进行化学热力学计算,收稿日期:2013.08—26;修回日期:2013—10.22基金项目:上海市重点学科项目(T0503

8、和P0502);上海市“创新行动计划”国际科技合作项(12430702000);上海市自然科学基金f12ZR1420400)上海市联盟计划项目和上海理工大学人文社会科学基金项目(11XSY23)作者简介:刘立(1989—’,女,上海人,食品工程硕士研究生,E—mail:1iuli0824@hotmail.corn联系人:李代禧(1975—,男,副教授,硕士研究生导师,研究方向:计算生物学,E—mail:dxli75@126.com刘立,等:硫普罗宁药物的葫芦脲包合物稳定性研究76l最终得出包合物

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