基于线粒体cytb和核基因zfy探讨羊族物种之间的系统发生关系

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1、兽类学报,2014,34(4):366-373ActaTheriologicaSinica基于线粒体Cytb和核基因ZFY探讨羊族物种之间的系统发生关系!*朱睦楠周材权何娅黄燕路迪曾小华(西华师范大学生命科学学院珍稀动植物研究所,西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川省环境科学与生物多样性保护重点实验室,四川南充637009)摘要:为了阐明羊族物种之间的系统发生关系并解决岩羊属中矮岩羊物种的有效性问题,本文测定了来自金沙江河谷地区栖息于林线以上岩羊和林线以下矮岩羊共226份粪便DNA样品的线粒体Cytb基因全序列(1140bp)和核基因ZF

2、Y部分序列(612bp),结合从GenBank中检索到的羊族物种同源DNA序列进行比较,利用最大简约法和最大似然法构建分子系统发育树,根据获得的拓扑结构初步探讨它们的系统进化关系。结果表明,绵羊属的绵羊与山羊属、塔尔羊属、岩羊属各物种亲缘关系最远,喜马拉雅塔尔羊和岩羊属、山羊属的亲缘关系最近。在进化树的岩羊属这一分支中,金沙江河谷地带岩羊和矮岩羊与内蒙古、青海、四川其它地理种群的岩羊聚为一支,同时分布在这一区域的部分岩羊和矮岩羊在Cytb基因和ZFY基因单倍型上存在共享现象。历史上的气候事件可能造成金沙江河谷地带岩羊和矮岩羊种群之间相互迁移,偏雄

3、性扩散促进了各地理种群之间的基因交流。因此不支持矮岩羊为独立的物种,建议将金沙江河谷地带的岩羊和矮岩羊都划分到岩羊四川亚种(Pseudoisnayaurszechuanensis)。由于它们的形态和生态上存在一定的分化,建议将林线以下矮岩羊作为一个独立的管理单元进行保护与管理。关键词:Cytb;ZFY;系统进化;偏雄性扩散;四川亚种中图分类号:Q346.3文献标识码:A文章编号:1000-1050(2014)04-0366-08Exploringthephylogeneticrelationshipsamongspeciesoftribecapr

4、inibasedonmitochondrialCytbandnucleargeneZFY!*ZHUMunan,ZHOUCaiquan,HEYa,HUANGYan,LUDi,ZENGXiaohua(InstituteofRareAnimalsandPlants,CollegeofLifeSciences,ChinaWestNormalUniversity,KeyLaboratoryofSouthwestChinaWildlifeResourceConservation,MinistryofEducation;SichuanProvincialKey

5、LaboratoryofEnvironmentalScienceandBiodiversityConservation,Nanchong637009,China)Abstract:ToexplorethephylogeneticrelationshipsamongtribecapriniandthespeciesvalidityofPseudoisschaeferiinPseudois,thetotalsequenceofmitochondrialCytb(1140bp)andpartialsequenceofthenucleargeneZFY(

6、612bp)weredetectedin226fecalDNAsamplesofPseudoisnayaurandPseudoisschaeferilivingaboveandbelowtheforestline,respectively,inthevalleyareaoftheJinshaRiver.ThesesequenceswerecomparedtothehomologousDNAsequencesofthetribecapriniretrievedfromGenBank,thenwereconstructedphylogenetictr

7、eeusingmaximumparsimony,maximumlikelihoodmethods,primarilytoinvestigatethephylogeneticrelationshipamongthesespeciesbasedonobtainedtopologicalstructure.TheresultsshowedthatthekinshipwasthefarthestbetweenOvisandothergeneraincludingCapra,PseudoisandHemitragus.Hemitragusjelahicus

8、wasthenearestrelativebetweenPseudoisandCapra.PseudoisnayaurandthePse

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