菌种鉴定定义

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1、菌种鉴定编辑菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。-•般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也冇例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。1鉴定手段常规鉴定h动鉴定分子生物学鉴定・API细菌鉴定2功能鉴定技术分析其他手段鉴定手段编辑常规鉴定常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、腮反应和血清学反应等。自动鉴定BIOLOG鉴定系统以微4.物对不同碳源的利用情况为基础,检测微

2、乞物的特征指纹图谱,建立与微牛物种类相对应的数据库。通过软件将待测微纶物与数据库参比,得岀鉴定结果。该系统已获美国FDA认可,已逐步应用于食甜和饮胡企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微牛:物、生物治理、化妆站、临床等领域的微牛:物鉴定试验中。CICC拥有国内最全的BIOLOG数据库,涉及革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内近2000种微牛物。分子生物学鉴定应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群Z间的分类学关系,是微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。CICC拥有微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室,配有

3、PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备,以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX.TREEVIEW等序歹ij分析软件。CICC町采用核酸序列分析法分析细菌16SrDNA/16S-23SrDNA区间序列、酵母18SrDNA/26SrDNA(D1/D2)序列及丝状真菌的18SrDNA/ITS1-5.8S-ITS2序列,提供科学的鉴定结果。API细菌鉴定API鉴定系统涵盖15个鉴定系列,约冇1000种生化反应,已可鉴定超过600种的细菌。鉴定过程中,可根据细菌所属类郡选择适当的生

4、理生化鉴定系列,通过软件将待测细菌与数据库参比,得出鉴定结果。CICC可应用API50CH系列、API20E系列、APIStaph系列对乳酸杆菌(Lactobacillussp.)和相关细菌、芽砲杆菌(Bacillussp.)、葡萄球菌属(Staphylococcussp.)、微球菌属(Micrococcussp.)和库克菌属(Locuriasp.)进行鉴定。功能鉴定郁技术分析功能性分析及功能基因CICC不断致力于工业微牛.物资源的功能及其功能基因研究,通过木聚糖酶、纤维索酶、葡萄糖界构酶、0■甘露聚糖酶等功能基因的克隆进行菌种产酶

5、的功能性分析。应用gy「A、atpD及pheS等看家基因于微牛物菌种鉴定,在某些种、亚种、株间有较好的分辨效果。RAPD、SSCP技术随着微牛物菌种应用的进一步发展,在食品安全管理、牛物产站出口认证、知识产权保护等行业需求FI益增加,微牛物菌种株水平的鉴别技术成为一个迫切需要解决的问题。CICC采用随机扩增多态性DNA(RandomlyamplifiedpolymorphismDNA,RAPD)技术和单链构象多态性(SingleStrandConformationPolymorphism,SSCP)技术对微生物菌株进行鉴别。如采用R

6、APD技术能够对同一菌种原始菌株与诱变菌株进行鉴别,对诱变菌株知识产权保护具冇重要意义;采用SSCP技术进行工业酒精酵母菌株的鉴别,此技术结合菌株发酵特性,在酒类生产的质虽控制方面起到积极作用。TLC薄层层析CICC将TLC薄层层析技术应用于微牛物菌种鉴定,进行细菌、放线菌细胞壁化学组分分析(氨基酸、糖),作为划分属特征的重要鉴定技术手段,起到了良好的辅助作用。全细胞脂肪酸分析鉴定系统采用Sherlock全自动细菌鉴定系统,通过对不同菌株的脂肪酸图谱进行分析,并与标准数据库进行比对,来鉴定细菌及酵母。该技术是细菌或酵母种水平鉴定的有

7、效于•段之一。(9)(G+C)mol%及DNA/DNA杂交CICC通过采用DU800核酸蛋白分析仪测定Tm值,从而得到微生物菌株的(G+C)mol%,并打模式菌株进行DNA/DNA同源性分析,该鉴定技术手段是多相鉴定的重要组成部分。其他手段CICC可根据客户的特殊要求,为您量身定做,提供相应的技术服务,具体事宜请来电咨询。

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