淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析

《淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、学校代码：10264研究生学号：M090107266上海海洋大学硕士学位论文淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性题目：及系统演化分析MolecularGeneticsDiversityandPhylogeographyof英文题目：OrientalRiverPrawnMacrobrachiumnipponensePopulationsinHuaiheRiverBasin专业：动物遗传育种与繁殖研究方向：水产动物种质资源与遗传育种姓名：姜虎成指导教师：李家乐冯建彬汪桂玲二O一二年月日上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注王群华东

2、师范大学教授主席邹曙明上海海洋大学教授委员沈和定上海海洋大学教授委员沈玉邦上海海洋大学讲师秘书答辩地点生命院C217答辩日期2012/5/20上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关

3、保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析摘要日本沼虾（Macrobrachiumnipponense）是我国最重要的淡水经济养殖虾类，淮河流域是我国日本沼虾种质资源分布较多

4、的主要区域之一。近20年来，淮河流域日本沼虾由于过度捕捞及长期环境恶化等原因出现了种质资源衰退现象，本研究，利用微卫星标记（SSR）和线粒体COI序列变异分析了淮河流域17个日本沼虾野生群体（半岗、城东湖、正阳关、焦岗湖、花家湖、瓦埠湖、高塘湖、芡河、天河、花园湖、五河、女山湖、老子山、金湖、界首、高邮、邵伯湖）的种质资源遗传多样性和系统演化，为淮河流域日本沼虾种质保护、资源利用和良种选育等提供基础资料。主要内容如下：1.淮河流域日本沼虾野生群体遗传多样性的微卫星分析利用13对中高多态性的微卫星引物分析了淮河流域日本沼虾野生群体的遗传结构和遗传多样性。

5、结果表明：17个群体中共有192个位点经Bonferroni校正后显示杂合不足且显著偏离Hardy-Weinberg平衡；群体平均期望杂合度均小于0.716，显示出较低的遗传多样性水平，其中女山湖、邵伯湖群体遗传多样性相对较高，正阳关、高塘湖群体相对较低；淮河日本沼虾群体偏离了突变-漂移平衡，呈现出遗传多样性下降的趋势，说明群体即将或曾经经历瓶颈效应；群体间AMOVA分析表明，群体间遗传分化程度较低，淮河日本沼虾分化形成了中游和下游2个大类群，中游安徽段没有形成显著的遗传结构，在种质资源保护和管理上可将安徽段种群视作一个单元，这为日本沼虾种质资源保护和

6、合理开发利用提供了基础资料。III上海海洋大学硕士学位论文2.淮河流域日本沼虾野生群体遗传多样性及系统演化的线粒体COI序列分析测定了淮河流域17个日本沼虾野生群体共248个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I（COI）部分序列，获得623bp核苷酸片段，包括48个变异位点，定义了31个单倍型，共享单倍型有12个，整体单倍型多样性和平均核苷酸多样性均处于中间水平。AMOVA分析表明，17个群体间的遗传分化系数FST＝0.0413（P<0.05），群体间遗传分化较小。Kimura2-paramter遗传距离在五河和焦岗湖、花家湖及瓦埠湖群体间最大为0.014

7、，在高邮和卲伯湖群体之间最小为0.003。最大简约性(MP)分析构建系统树与单倍型进化网络关系图具有较高的一致性，31个单倍型被分为3个进化枝，其中一个进化枝主要以下游群体为主，另外2个进化枝主要以中游群体为主。群体中性检验、错配分析表明淮河日本沼虾近期曾经历过种群扩张。关键词：日本沼虾，淮河流域，微卫星，线粒体COI，遗传多样性，系统演化IV上海海洋大学硕士学位论文MolecuarGeneticsDiversityandPhylogeographyofOrientalRiverPrawnMacrobrachiumnipponensePopulatio

8、nsinHuaiheRiverBasinABSTRACTOrientalriverprawn,