植原体核心基因组鉴定和小麦蓝矮植原体imp功能鉴定

植原体核心基因组鉴定和小麦蓝矮植原体imp功能鉴定

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1、分类号:S432.2学校代码:10712UDC:632研究生学号:2012050117密级:公开级灶农林奇祆大学2015届攻读顿士学位研究生学位(毕业)论文植原体核心基因组鉴定和小麦蓝矮植原体Imp功能鉴定学科专业植物病理学研究方向植物病毒研究生王强指导教师吴云锋教授完成时间2015年5月中国陕西杨凌研究生学位(毕业)论文的独创性声明本人声明:所呈交的博士学位(毕业)论文是我个人在导师指导下独立进行的研究工作及取得的研究结果;论文中的研究数据及结果的获得完全符合学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》,如果违反此规定,一切后果与法律责任均由本人承担。尽我所知,除了

2、文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究结果,也不包含其他人和自己本人已获得西北农林科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同事对本研究所做的任何贡献均已在论文的致谢中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间:年Jr月/〇曰导师指导研究生学位(毕业)论文的承诺本人承诺:我的博士研究生所呈交的博士学位(毕业)论文是在我指导下独立开展研究工作及取得的研究结果,属于我现岗职务工作的结果,并严格按照学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》而获得的研究结果。如果违反学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行

3、规定》,我愿接受按学校有关规定的处罚处理并承担相应导师连带责任。关于研究生学位(毕业)论文使用授权的说明本学位(毕业)论文的知识产权归属西北农林科技大学。本人同意西北农林科技大学保存或向国家有关部门或机构送叉论文的纸质版和电子版,允许论文被查阅和借阅;同意西北农林科技大学将本学位(毕业)论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国博士学位论文全文数据库》进行出版,并享受相关权益。本人保证,在毕业离开(或者工作调离)西北农林科技大学活,发表或者使用本学位(毕业)论文及其相关的工作成果时,将以西北农林科技大学为第一署名单位,否则,愿意按《中华人民共和国著作权法》等有关规定接受处理并承担法律

4、责任。任何收存和保管本论文各种版本的其他单位和个人(包括研究生本人)未经本论文作者的导师同意,不得有对本论文进行复制、修改、发行、出租、改编等侵犯著作权的行为,否则,按违背《中华人民共和国著作权法》等有关规定处理并追究法律责任。(保密的学位论文在保密期限内,不得以任何方式发表、借阅、复印、缩印或扫描复制手段保存、汇编论文)研究生签名:时间:年月曰Classificationcode:S432.2Universitycode:10712UDC:632Postgraduatenumber:2012050117Confidentialitylevel:PublicityThesisfo

5、rMaster’sDegreeNorthwestA&FUniversityin2015IDENTIFICATIONOFACONSERVEDPHYTOPLASMACOREGENOMEANDFUNCTIONALCHARACTERIZATIONOFIMPFROMWHEATBLUEDWARFPHYTOPLASMAMajor:PlantPathologyResearchfield:PlantVirusNameofPostgraduate:QiangWangAdviser:YunfengWuDateofsubmission:May2015YanglingShaanxiChina植原体核心基因

6、组鉴定和小麦蓝矮植原体Imp功能鉴定摘要在中国西北干旱半干旱地区,小麦蓝矮植原体病害是制约小麦产量的一类重要病害。目前发现小麦蓝矮植原体在田间是由条沙叶蝉进行传播。该病周期性的在西北地区发生,造成小麦严重减产。目前由于植原体无法在人工合成培养基上进行培养,因此植原体的研究受到很大的制约。当前,人们已经利用高通量测序技术获得很多植原体基因组序列。基于功能基因组学,人们对病原效应蛋白或者其它致病因子有了更进一步的探究。本实验对当前测序植原体基因组进行比较基因组学分析,鉴定一个保守的植原体核心基因组,并且找出植原体不同组之间潜在致病效应蛋白的差异。同时,初步揭示了小麦蓝矮植原体免疫膜蛋

7、白Imp的功能特点。本研究为将来植原体基因组的组装,植原体功能基因组的深入探索提供了新的借鉴。利用BioLinux平台对10个分布于5个不同组的植原体基因组进行比较基因组学的分析,结果发现这10个基因组共同含有170个保守的核心基因。有趣的是,核心基因组中并未包含保守的潜在分泌性蛋白(潜在效应因子)。这说明植原体的效应蛋白不同组之间是多样化的,其组间致病机理也可能具有差异性。在核心基因组中,占据最大比例的是一些参与基本功能的基因,像是参与转录,翻译,生物合成类的基因。另外,我们利

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