许氏平鲉（sebastes schlegelii）est-ssr标记开发及快速生长选育系遗传结构分析

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1、学校代码：10264研究生学号：M120101001上海海洋大学硕士学位论文许氏平鲉（Sebastesschlegelii）EST-SSR标题目：记开发及快速生长选育系遗传结构分析DevelopmentofEST-SSRMarkersandGeneticsAssessmentofFast-growing英文题目：BreedingLinesforTheBlackRockfish,Sebastesschlegelii专业：水产养殖研究方向：鱼类遗传育种姓名：薛蕊姜海滨研究员指导教师：马海涛博士二O一五年六月十五日上

2、海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：2015年6月15日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允

3、许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：2015年6月15日日期：2015年6月15日上海海洋大学薛蕊硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注孙振兴鲁东大学教授主席中国科学院烟台海岸带研赵建民研究员委员究所杜荣斌烟台大学教授委员山东省海洋资源与环境研陈建强秘书究院山东省海洋资源与环境研答辩地点答辩日期

4、20150609究院上海海洋大学硕士学位论文许氏平鲉EST-SSR标记开发及快速生长选育系遗传结构分析摘要许氏平鲉（Sebastesschlegelii）是我国北方近海重要的岩礁性鱼类，由于具有广温广盐习性，可以自然越冬，也是我国北方沿海深水网箱养殖和增殖放流的适宜经济鱼种，但近年来其渔业资源减少严重，因此进行许氏平鲉人工繁育及良种选育具有重要的经济效益和社会效益。微卫星标记技术能够为许氏平鲉良种选育提供一定的技术支持，尤其是在分子标记辅助育种等方面。EST-SSR开发成本低，且在不同物种间具有一定的通用性，已

5、经成为新型高效的开发微卫星标记的途径。许氏平鲉是卵胎生鱼类，具有一雌多雄的交配模式，对其选育系的遗传结构进行监测、分析其遗传多样性以及遗传分化情况具有十分重要的实践意义。本研究首次利用已发表的许氏平鲉EST序列进行EST-SSR标记开发，以期为许氏平鲉良种选育提供更多标记选择，同时选用8对扩增效果好、多态性丰富的微卫星引物对17个许氏平鲉快速生长选育系的遗传结构进行分析，以期为许氏平鲉种质资源保护、良种选育等工作提供支持。1、许氏平鲉EST-SSR标记的开发及通用性检测从NCBI公共数据库下载的1980条EST

6、序列经拼接、SSR位点查找后，发现EST-SSR位点的发现率为9.14%，所有EST-SSR位点中完美型比例占到91.52%，其中，二碱基重复出现频率最高，以TG/CA基序最多，三碱基重复类型最多，四到六碱基所有重复类型皆出现一次。从中挑选、设计引物56对，46对引物能够有效扩增，18个位点具有多态性。18个多态位点共检测出70个等位基因，每个位点观测等位基因数（Na）为2~9，平均观测等位基因数为3.89；平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别达到0.3037和0.3757；每个位点的平均多态信息

7、含量（PIC）为0.3419，中高度多态位点比例达到50.00%；经Bonferroni校正后，仍有3个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡（P<0.0028），但两两位点间不存在连锁不平衡现象。位点通用性检测结果显示，在朝鲜平鲉中除位点HJ606和HJ4183其余位点均能有效扩增，其中6个位点多态；在褐菖鲉中所有位点均能有效扩增，除位点HJ4215和HJ4286单态外其余位点均为多态；18个位点在朝鲜平鲉和褐菖鲉中的I上海海洋大学硕士学位论文通用率分别是88.89%和100%，多态率为33.33%和8

8、8.89%。本研究开发的许氏平鲉EST-SSR标记多态性较高，在近缘物种中具有很高的通用性，可用于许氏平鲉系统进化分析、近缘种通用性检测以及分子标记育种等工作，并且为许氏平鲉良种选育以及构建更高密度遗传连锁图谱提供了更多的标记选择。2、17个许氏平鲉快速生长选育系的遗传结构分析本研究采用高分辨率的毛细管电泳进行SSR分型检测，8个标记在17个选育系中共检测到181个等位基因。选育系遗传