虾夷扇贝(patinopecten yessoensis)mapkk基因家族结构及表达分析

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1、?f齡义々、i、tNIVFRSnYOFOUNA硕±学位论文IMASTERDISSERTATION師夷扇贝(戶抓wopecfcnyewoew地)MAPKK论文涵目:基因家族结构及表达分析G州estructureandtranscritionalreulationofpg-mitoenactivatedroteinkinasekinasesMAPKKgp()巧文抵目:ofYessoscayllop尸口/mopgc化/IygMog化k作者;邹佳君指导教师:巧巧丽教授

2、学位类别:全日制学术硕±专业名巧:海洋生物学硏巧方向:海洋生物适传学.#.打|苗巧夷扇贝(尸afynoecfen基因家族结构及表达分析f谨从此文献给我亲爱的父母和敬爱的导师邹佳芳2015年5月MA*虫下夷扇贝戶口伽旅n紛soms/5FKK基因家族()结构及表达分析:学位论文答辩日期?/指导教师签字:答辩委员会成员签字:…-聲房淨M独创靑明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研巧成果。据我所知,除了文中特别加W标注和致谢的地方

3、外,论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研巧成果,也不包含未获得(注;如没有其他需要特别声明的,本栏可空)或其他教育机构的学位或证书使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。l,学位论文作者签名:名签字日期:年月/日学位论文版巧使用授巧书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,并同意W下事项:1、学校有权保留并向国家有关部n或机构送交论文的复印件和磁益,允许论文被査阅和借阅。2、学校可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可W采"用

4、影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学中"国学术期刊光盘版)电子杂志社用于出版和编入CNKI《中国知识资源总库》,(授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。(保密的学位论文在解巧后适用本授权书)学位论文作者签名:导师签字,I古?签字曰期:年>:!月曰签字曰期2年r月2^曰0/f巧夷巧巧化邸ecnMAPKK(fe/ess0e/7SJS)基因家巧结构及表达分析'‘虫下夷扇贝(戶at//7〇pecfe/7yessoe/7s/s)MAPKK基因家族结构及表达分析

5、摘要oen-有丝分裂原活化蛋白激酶MAPK(Mitgactivatedproteinkinase)信号通路将细胞外刺激逐级传递至细胞内部诱导产生一系列的细胞反应,,调控细胞活动和免疫反应。MKK将上游MKKK信号整合传谨至下游MAPK,被认为是MAPK信号通路的关键节点。本文利用生物信息技术对奸夷扇贝基因进行了基因组和转录组筛查,并对其系统发生关系进行了分析。研巧结果表明,虫下5)夷扇贝基因组巧含有个J/Zf/rA,ny基因(AWT其中含有特殊的Gi一一重复,同MKK在物种间的保守性高于同物种内不同MKK家族成员间的保

6、守性在奸夷扇贝胚胎幼虫各发育阶段、成体各组织中均检测到5个/;基因的表达;细菌胁迫后,砰夷扇贝血细胞中日个/yWT基因的表达量均,部分基因间的表达量变化呈显著相关发生显著改变。主要研巧结果如下:1化夷扇巧基因家族结构分析本研究通过全面筛查砰夷扇贝基因组和转录组数据,获得邮夷扇贝ww家族全熟蹇沿,l/2MKK4PyMM5PyMKK3/6轉PymK7包猜五个放黄,PyMK,,,,巧其开放阅读框(Openreadingframes,ORF)分别为1206,1143,1401,]107和927b401380466368

7、8个p,分别编码,,,和30気基酸;理论分子量分别为44.4043.6953.2141.6935.21kDai6.356.285,,,和;等电点p分别为,,.44,7.05和8.20。进化分析和蛋白分析结果表明:PyMKK与其它软体动物MKK聚类为单独亚支,其次与其它无脊椎动物MKK聚类。MKK在物种间的保守性高于家族间成员的保守性。PyMKK在结构上也离度保守,相关的保守功能位点包括:MAPKMKKl2PMKK4含2PMKK5含1个PMKK3对接位点,Py含个,y个,y,y^含1个,--P

8、yMKK7含1个1433,PMKKl/24,PMKK5;蛋白家族作

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