基于新一代测序的微生物检测快速计算方法研究

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1、分类号TP303学号14060111ＵＤＣ密级公开工学硕士学位论文基于新一代测序的微生物检测快速计算方法研究硕士生姓名周子寒学科专业软件工程研究方向生物信息学指导教师彭绍亮副研究员国防科学技术大学研究生院二〇一六年十一月ResearchofRapidMicrobeDetectionComputationalMethodsBasedonNGSCandidate：ZIHANZHOUAdvisor：AssociateProfessorSHAOLIANGPENGAdissertationSubmittedinpartialfulfi

2、llmentoftherequirementsforthedegreeofMasterofEngineeringinSoftwareEngineeringGraduateSchoolofNationalUniversityofDefenseTechnologyChangsha，Hunan，P.R.China（November，2016）国防科学技术大学研究生院硕士学位论文目录摘要..........................................................................

3、.......................................iABSTRACT.........................................................................................................ii第一章绪论........................................................................................................1

4、1.1课题来源............................................................................................................11.2课题背景和研究意义........................................................................................11.3利用NGS进行微生物检测面临的挑战............................

5、..............................41.3.1生物大数据的挑战.................................................................................41.3.2移动测序的挑战.....................................................................................51.4本文的组织结构...............................

6、.................................................................6第二章快速微生物检测计算分析......................................................................82.1基于NGS的微生物检测计算数据处理策略..................................................82.2现有微生物检测计算方法...........................

7、...................................................112.2.1基于软件拼接的检测方法...................................................................112.2.2基于k-mer加速的检测方法................................................................132.2.3基于体系结构优化的检测方法........................

8、...................................132.3本章小结.....................................................................................................