转录和转录组学transcriptom

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1、转录和转录组学ThanscriptionandTranscriptomics吕社民,M.D.,Ph.D.西安交通大学医学院遗传学与分子生物学系电话:82657764Email:lushemin@mail.xjtu.edu.cnReplicationReplicationTranscriptionReverseTranscriptionTranslation中心法则(thecentraldogma)TheRoyalSwedishAcademyofScienceshasdecidedtoawardtheNobelPrizeinChem

2、istryfor2006toRogerD.KornbergStanfordUniversity,CA,USA"forhisstudiesofthemolecularbasisofeukaryotictranscription".RogerD.Kornberg,born1947(59)inStLouis,MO,USA(UScitizen).PhDfromStanfordUniversity,CA,USA.Mrs.GeorgeA.WinzerProfessorinMedicineatStanfordUniversitySchoolof

3、Medicine,CA,USA.OriginalscientificarticlesCramer,P.,Bushnell,D.A.andKornberg,R.D.(2001)Structuralbasisoftranscription:RNApolymeraseIIat2.8ångstromresolution.Science292,1863-1876.Gnatt,A.L.,Cramer,P.,Fu,J.,Bushnell,D.A.andKornberg,R.D.(2001)Structuralbasisoftranscripti

4、on:AnRNApolymeraseIIelongationcomplexat3.3Åresolution.Science292,1876-1882.Bushnell,D.A.,Westover,K.D.,Davis,R.E.andKornberg,R.D.(2004)Structuralbasisoftranscription:AnRNApolymeraseII–TFIIBcocrystalat4.5angstroms.Science303,983-988.ReviewarticleBoeger,H.,Bushnell,D.A.

5、,Davis,R.,Griesenbeck,J.,Lorch,Y.,Strattan,J.S.,Westover,K.D.andKornberg,R.D.(2005).Structuralbasisofeukaryoticgenetranscription.FEBSLett.579,899-903.SeveroOchoaArthurKornberg1/2oftheprize1/2oftheprizeUSAUSANewYorkUniversity,CollegeofMedicine NewYork,NY,USAStanfordUni

6、versity Stanford,CA,USAb.1905 (inLuarca,Spain) d.1993b.1918TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1959"fortheirdiscoveryofthemechanismsinthebiologicalsynthesisofribonucleicacidanddeoxyribonucleicacid"2006年诺贝氏生理医学奖得主Dr.FireAandDrMelloC主要内容一、核糖核酸的类型、结构和功能二、RNA的合成三、真核细胞转录后修饰

7、四、转录水平的基因表达调控五、RNA分析六、转录组学一、核糖核酸的类型、结构和功能类型编码蛋白质:编码RNA和非编码RNA功能:rRNA,tRNA,mRNA小RNA(snRNA,snoRNA,scRNA)2.核糖核酸的结构和功能4种核苷糖以磷酸二酯键连接的长链,A、U、C、G;戊糖是核糖。2.1mRNA2.1.1.原核生物mRNA结构的特点:(1)多顺反子;(2)mRNA5′端无帽子结构,3′端无多聚A尾;(3)mRNA一般没有修饰碱基。2.2.2.真核生物mRNA结构的特点:(1)5′端有帽子结构;(2)大多3′端有多聚A尾;(

8、3)分子中可能有修饰碱基:主要有甲化;(4)分子中有编码区与非编码区。2.2tRNA1.单链小分子;2.含有稀有碱基或修饰碱基;3.5′端总是磷酸化,5′末端往往是pG;4.3′端是CpCpAoH序列;5.三叶草结构;6.三级结构是倒L型。三级结构

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