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1、杆状病毒系统发育研究孙兴强，邓日强，王瑾雯，王殉章(中山大学生命科学学院，广州510275)摘要：杆状病毒(Baculovirus)是主要寄生于节肢动物的具有贵白包膜包被的闭合双链环状DNA病毒,基因组大小为80-180kb之间。其宿主包括鳞翅目(Lepidoptera)x膜翅目(Hymenoptera)和双翅目(Diptera)的昆虫。本文利用基丁单基因、多基因和全基因组水平上的5种方法对杆状病毒分进行系统发育树构建，并比较这些系统树的差別。首先，根据31个核心基因构建31棵单基因系统发育树，并综合这31棵系统树对其进行一致性分析。然后，根据31个核心基因的多序列比对结
2、果，进行基因拼接并进行系统发育分析。接着，基于组分矢htffi-(CVtree)对杆状病毒全基因进行系统发育分析并利用主成分分析的结杲将54株杆状病毒展示在三维立体空间。与系统树相比，三维空间方式展示物种亲缘性，为我们提供了另外的视野。最后，本文基于局部相似比对(GBDP)方法对杆状病毒全基因组进行系统发育分析。另外，本文分別对5种系统发育树进行了比较并进行系统聚类分析。通过比佼发现，绝人多数的系统树赞同目前将杆状病毒科分成4个属，即Alpha杆状病毒属(以鳞翅目昆虫为特异宿主的NPV),Beta杆状病毒属(以鳞翅冃昆虫为特异宿主的GV),Gamma杆状病毒属(以膜翅日昆
3、虫为特异宿主的NPV)以及Delta杆状病毒属(以双翅目昆虫为特异宿主的NPV),并且Alpha杆状病毒属和Beta杆状病毒属都可以继续分为GroupI和GroupII0另外本文对最新进行全基因测序目-在NCBI标明耒分类的杨扇舟蛾颗粒体病毒(Closteraanachoretagranulovirus,CaGV)进彳了了分类，确定CaGV为Beta杆状病毒属的GroupIL关键词：杆状病毒；系统发育；核心基因；全基因组中图分类号：Q939.4PhylogeneticanalysisofBaculovirusesSUNXingqiang,DENGRiqiang,WANGJ
4、inwen,WANGXunzhang(SchoolofLifeScience,SunYat-sen(Zhongshan)University,GuangZhou510275)Abstract:Baculovirusesaremainlyarthropod-specificvirusesinfectinginsectsofLepidoptera,Hymenoptera,andDiptera,withdoublestrandedcircularDNAgenomesof80to180kbp・Thispaperconstructedandcomparedbaculoviruses
5、phylogenetictreeswith5differentmethods,whicharebasedonasinglegene,onmultiplegenesoronwhole-genomesequenceinformation.Therepresentativetreesbythefivemethodswerethencomparedandanalyzedbyusinghierarchicalclustering.Mostphylogenetictreesconstructedbytheabovemethodssupportedthecurrentdivisiono
6、fthefamilyBaculoviridaeintofourgenera,Alphabaculovirus(lepidopteran-specificbaculoviruses),Betabaculovirus(lepidopteran・specificgranulovirusa),Gammabaculovirus(hymenopteran-specificbaculoviruses)andDeltabaculovirus(dipteran-specificbaculoviruses)・BothAlphabaculovirusandBetabaculoviruscanb
7、esubdividedintotwoparts,GroupIandGroupII,respectively・ThenewlysequencedbaculovirusClosteraanachoretagranulovirus(CaGV)thatisstillunclassifiedinNCBIwassuggestedinthisstudybeingamemberofBetabaculovirusGroupII.Keywords:phylogeneticanalysis;baculorvirus;coregenes;whole-
