基于细胞色素b序列的罗非鱼选育群体遗传变异分析-论文.pdf

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1、第３５卷第５期暨南大学学报（自然科学与医学版）Ｖｏｌ．３５Ｎｏ．５２０１４年１０月ＪｏｕｒｎａｌｏｆＪｉｎａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ＆ＭｅｄｉｃｉｎｅＥｄｉｔｉｏｎ）Ｏｃｔ．２０１４基于细胞色素ｂ序列的罗非鱼选育群体遗传变异分析１２颉晓勇，李思发（１．中国水产科学研究院南海水产研究所，广东省渔业生态环境重点实验室，广东广州５１０３００；２．上海海洋大学，上海２０１３０６）［摘要］对吉富品系尼罗罗非鱼（Ｏｒｅｏｃｈｒｏｍｉｓｎｉｌｏｔｉｃｕｓ）不同世代选育群体细胞色素ｂ序列进行测定和分析，４５个样本经重排比较后获得１０６４ｂｐ的同源序列．共检测到１６１个变异

2、位点，占分析位点数的１５１３％．同源序列中多态位点比例随着选育世代数的累进，呈现出降低的趋势，Ｆ０、Ｆ６、Ｆ７、Ｆ８、Ｆ９代分别为１４３８％、１３４７％、１３３８％、１０２４％、９４９％．核苷酸多样性指数也呈现出同样的降低趋势，Ｆ０、Ｆ６、Ｆ７、Ｆ８、Ｆ９代分别为００６５４７、００４９０５、００４８８１、００３６１９、００３３８１．本研究结果表明，新吉富罗非鱼仍保持了一定程度的遗传变异水平，新吉富罗非鱼逐步趋于纯化．［关键词］罗非鱼；选育；细胞色素ｂ序列；遗传变异［中图分类号］Ｑ３４７［文献标志码］Ａ［文章编号］１０００－９９６５（２０１４）０５－０４３９－０６

3、ｄｏｉ：１０．１１７７８／ｊ．ｊｄｘｂ．２０１４．０５．００４ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｔｉｌａｐｉａｄｕｒｉｎｇｓｅｌｅｃｔｉｏｎｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇｂａｓｅｄｏｎｍｔＤＮＡｃｙｔｂｓｅｑｕｅｎｃｅ１２ＸＩＥＸｉａｏｙｏｎｇ，ＬＩＳｉｆａ（１．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆｆｉｓｈｅｒｙＥｃｏｌｏｇｙａｎｄｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ，ＧｕａｎｇｄｏｎｇＰｒｏｖｉｎｃｅ；ＳｏｕｔｈＣｈｉｎａＳｅａＦｉｓｈｅｒｉｅｓＲｅｓｅａｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｉｓｈｅｒｙＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０３００，Ｃｈｉｎａ；２．

4、ＳｈａｎｇｈａｉＯｃｅａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２０１３０６，Ｃｈｉｎａ）［Ａｂｓｔｒａｃｔ］ＴｈｅｍｔＤＮＡｃｙｔｂｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆＧＩＦＴｓｔｒａｉｎＯｒｅｏｃｈｒｏｍｉｓｎｉｌｏｔｉｃｕｓｉｎＦ０，Ｆ６－９ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｗｅｒｅａｍｐｌｉｆｉｅｄａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅｄ．１６１ｌｏｃｉｗｅｒｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃａｎｄａｃｃｏｕｎｔｅｄｆｏｒ１５１３％ｉｎ１０６４ｂａｓｅｐａｉｒｓｏｆ４５ｓａｍｐｌｅｓ．Ｔｈｅｒａｔｉｏｏｆｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｌｏｃｉｗａｓ１４３８％，１３４７％，１３３８％，１０２４％，９４９％，ａｎｄｎｕｃｌｅｏｔ

5、ｉｄｅｄｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎｄｅｘｗｅｒｅ００６５４７，００４９０５，００４８８１，００３６１９，００３３８１ｆｏｒＦ０，Ｆ６，Ｆ７，Ｆ８，Ｆ９，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏｆｇｅｎｅｔｉｃｄｉｓｔａｎｃｅ，ｒａｔｉｏｏｆｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｌｏｃｉａｎｄｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｄｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎｄｅｘａｍｏｎｇｔｈｅｓｅｆｉｖｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓ，ｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｓｅｌｅｃｔｅｄｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｗｅｒｅｇｅｔｔｉｎｇｐｕｒｅｒａｆｔｅｒｓｅｌｅｃｔｉｏｎｐｒｏｃｅｓｓ．［Ｋｅｙｗｏｒｄｓ］ｔｉｌａｐｉａ；ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ；ｃｙｔ

6、ｂｓｅｑｕｅｎｃｅ；ｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙ选择育种是对经济动物进行遗传改良的重要手道较少，人们对选育群体遗传性状的变化情况所知段之一，有关鱼类选育群体遗传结构分析的研究报有限．吉富品系尼罗罗非鱼（Ｏｒｅｏｃｈｒｏｍｉｓｎｉｌｏｔｉｃｕｓ）由［收稿日期］２０１４－０４－１４［基金项目］国家“十五”攻关项目（２００１ＢＡ５０５Ｂ０５１３）；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金（中国水产科学研究院南海水产研究所）资助项目（２００７ＴＳ０４）［作者简介］颉晓勇（１９７６－），男，博士，研究方向：水产动物种质资源与养殖技术研究．Ｔｅｌ：０２０－８４４５９４４０；Ｅｍａｉｌ：ｘ

7、ｉｅｘｉａｏｙｏｎｇｓｈ＠ｓｉｎａ．ｃｏｍ４４０暨南大学学报（自然科学与医学版）第３５卷上海水产大学引进中国之后，进行了９代的选育改１．４ＤＮＡ测序良，成为一个生产性状优良的“新吉富罗非鱼”新品ＰＣＲ的扩增产物用１％的琼脂糖凝胶进行电泳种（登记号ＧＳ０１００１２００５，农业部公告第６３１号）．检测，对特异性的ＰＣＲ扩增产物进行纯化，由上海采用ＤＮＡ序列测定等现代分子生物学手段，对选育生物工程技术服务有限公司用ＡＢＩ３７７ＤＮＡ自动群体经历的内在遗传变异