基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统发育关系和不同虹鳟养殖群体遗传变异.pdf

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1、第34卷第6期水产科学V(】I．3dNO．62015年6月FISHER1ESSCIENCEJLIII．2015I)()I：10．16378／j．cnki．10031111．20l5．06．009基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统发育关系和不同虹鳟养殖群体遗传变异王伟伟(山西农业大学动物科技学院，山西太谷030801)摘要：采用PCR技术扩增了中国不同虹鳟群体的细胞色素b基因，对虹鳟不同养殖群体进行了遗传多样忤分析，并与鲑业科中其他5属11个物种的细胞色素b基因进干亍同源性比较，建立了主要养殖鲑

2、业科鱼类的系统关系。试验结果显示，虹鳟种内本地虹鳟群体遗传离最小(0．001)，道氏群体最高(0．004)。种间遗传距离以哲罗鲑与马苏大麻哈伍的遗传距离最大(0．127)，其次为哲岁舛与银大麻哈鱼(0．123)，以远东红点鲑和美洲红点鲑的最近(0．003)。聚类分析表明，同属的鱼均能单独聚类，哲岁血属和绌鳞鱼属聚存一起，鲑属与红点鲑属聚彳F·起。虹鳟小I百=j群体间并没有独聚类，提示不虬鳟群体『日J没有发生明显的遗传分化。关键词：虹鳟；鲑亚科；细胞色素b基；系统关系；遗传变异中图分类号：S917文献标识

3、码：A文章编号：l003lll1(2Ol5)06038605鲑鳟鱼类，是鳟鱼和鲑鱼的统称。如金鳟为了更好地保护、利用祠I开发鲑鳟鱼类种质资(One’orhynchusaguabonita)、虹鳟(0．mykiss)、褐源、保障鲑鳟鱼类养殖产业的健康可持续发展和科鳟(Salmotruttu)等都称为鳟鱼；美洲红点鲑学合理地开展遗传选育，开展鲑鳟鱼类的遗传多样(SalvelinlgSfontinalis)、大西洋鲑(S．salar)等都性分析和系统关系研究具有重要的科学意义和应属于鲑鱼。鲑鳟鱼类喜栖于净溶氧

4、高的冷水中，用价值。细胞色素b基因在鱼类群体和进化遗传对牛存环境的特殊要求，决定了其生态、环保的商学中的应用较为广泛。业价值，仵名特水产品养殖中，鲑鳟鱼类的养殖是本研究通过对中围主要养殖鲜鳟鱼类和皿r鳟很有前景的产业之一。20世纪50年代末首次从朝的不同养殖群体细胞色素b基【大J进行测序，研究我鲜引人虮鳟，开始了我国的鲑鳟鱼类的养殖，目前国虹鳟不同养殖群体的遗传特性，了解我同虹鳟养在同内北方已开展了大面积鲑鳟鱼类的养殖。殖群体遗传多样性水平，研究丰要养殖鲑鳟鱼类我国养殖的虹鳟引闩小同的国家，对于有限的的

5、亲缘关系，为开展鲑鳟鱼类的杂交育种提供理亲本数日经过不同形式的选择育种，势必造成一定论基础，为合理利用鲑鳟鱼类资源提供新的科学依据，对丰富我圈鲑鳟鱼类的基础研究，具有重要程度的遗传漂变。【大1为多数养殖群体离开原产地价值。多年，群体的遗传结构会发生一定的改变以及遗传多样性水平下降。虽然目前又经过多次的引种，但1材料与方法是对同内虹鳟群体的遗传结构尚缺乏整体的认识。1．1试验材料近年来我同义从不同的国家引进r金鳟、远东红点试验所用的材料为虹鳟道氏群体、虹鳟夯、群蚌(s．1eucomaenis)、美洲红点鲑

6、等养殖种类I，体、虹鳟本地群体、金鳟、远东红点鲑、美洲红点、对土著的哲罗鲑(Huchotaimen)也进行了人T养细鳞鲑(Brachymysta．vlenok)和哲罗鲑采fJ朔州巾殖，开展r相父的遗传多样性【。和杂交育种T虹鳟鱼种场(表1)，它们同属于鲑亚科，取样品的尾作。]，但是对其遗传基础和亲缘关系没有进行线鳍浸入95的酒精中定和保存。粒体水平的系统研究。收稿rI期：2Ol4lol4；修回日期：2015o120．展会项日：1【l两农业大学创新基金资助项口(20】0025)．作者简介：王伟伟(1979

7、一)，女，讲师，硕=．；研究力向：水产动物遗传育种第6期王伟伟：基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统表1本研究中的鲑科鱼类种类和样本数表2GenBank中其他鲑亚科鱼类细胞色素b基因的序列号2结果2．1碱基组成与变异对5属12种鲑亚科鱼类细胞色素b基因片段1．2基因组DNA提取序列进行比对，获得长度为1141bp的同源序列，DNA提取参照分子克隆胡进行。取20～3OT、C、A、G四种碱基的组成分别为29．1、30．9、24．69／6、15．4，A+T含量(53．7)高于(+C含mg尾鳍，剪碎。待

8、酒精完全挥发后，用蛋白酶K消化，酚⋯一氯仿法提取总DNA，用0．8琼脂糖凝胶量(46．3)，未见有碱基缺失和插人，核苷酸变异进行电泳检测。以转换为主。1．3基因扩增与测序共检测到247个变异位点，占分析位点总数的扩增细胞色素b基因所用通用引物参照文献21．65，碱基替换大多发生在密码子的第三位点(85．4Yo)，其次第一位点(1O．52)，第二位点最保[14]，由北京华大基因中心合成。PCR反应体系及反应条件参照文献[15]，仅退火温度改为