基于锚定PCR技术对10种重要农业害虫微卫星DNA位点的筛选及其特征分析-论文.pdf

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1、生物安全学报2014,23(1):60—65JOURNALOFBIOSAFETYhttp:ffwww.bscn.orgDOI:10.3969/j.issn.2095—1787.2014.o1.012基于锚定PCR技术对10种重要农业害虫微卫星DNA位点的筛选及其特征分析李慧,郎坤玲,沈长朋,李洁,陶云荔,褚栋青岛农业大学农学与植物保护学院,山东省植物病虫害综合防控重点实验室,山东青岛266109摘要:【背景】微卫星DNA广泛存在于真核和原核生物的基因组中,具有多态性丰富、易于检测等特点,在遗传图谱的构建、动植物遗传学育

2、种等方面被广泛应用。【方法】利用5锚定PCR技术对桃小食心虫、桃蛀螟、玉米螟、二点委夜蛾、花蓟马、黄胸蓟马、棕榈蓟马、斑翅果蝇、稻水象甲、扶桑绵粉蚧10种重要农业害虫进行微卫星DNA筛选,并分析各个物种的微卫星DNA的特点。【结果】不同物种的阳性克隆率、微卫星比率、克隆效率和冗余率存在不同程度的差异;在核苷酸碱基数目上,主要为二核苷酸重复序列,占重复位点总数的93.2%~100%,三、四核苷酸重复位点较少。在二核苷酸重复位点中,CA/TG重复位点最为丰富,占重复位点总数的89.2%~100%。这与使用的锚定引物密切相关

3、;10种害虫的微卫星DNA平均重复次数为6.7~8.9次,其中玉米螟具有最高的微卫星DNA重复次数(34次);在序列类型上,完全型序列占上述害虫序列总数的91.0%~100%。【结论与意义】5锚定PCR技术能够快速挖掘害虫的微卫星DNA位点,本研究结果为这些害虫微卫星位点的进一步利用奠定了基础。关键词:农业害虫;微卫星;5锚定PCR技术;克隆;特征分析IsolationandCharaCterizatiOnofmicrosatelliteDNAlocifrOmtenimportantagriculturalpestin

4、sectsusinganchoredPCRmethodHuiLI,Kun-lingLANG,Chang—pengSHEN,JieLI,Yun—liTAO,DongCHUKeyLaboratoryofIntegratedCropPestManagementofShandongProvince,CollegeofAgronomyandPlantProtection,QingdaoAgriculturalUniversity,Qingdao,Shandong266109,ChinaAbstract:【Background】M

5、icrosatelliteDNAconsistsofbothprokatryoticandeukaryoticgenomes.Thecharacteristicsincluderichpolymorphismandeasydetection.Thetechniquehasbeenappliedinanimalandplantgeneticsandbreeding,fortheconstructionforgeneticmaps.【Method】Usingthe5anchoredPCRmethod,microsatcll

6、iteDNAfrom10importantagriculturalpestswereisola—tedandanalyzed,includingCarposinasasakii(Lepidoptera:Carposinidae),Conogethespunctralis(Lepidoptera:Pyralidae),Ostrinianubilalis(Lepidoptera:Pyralidae),Proxenuslepigone(Lepidoptera:Noctuidae),Frankliniellaintonsa(T

7、hysanoptera:Thripidae),Thripshamaiiensis(Thysanoptera:Thripidae),Thripspalmi(Thysanoptera:Thripidae),Drosophilasuzukii(Diptera:Drosophilidae),Lissorhoptrusoryzophilus(Coleoptera:Curculionidae)andPhenacoccussolenopsis(Hemiptera:Pseudococcidae).Thecharacteristicso

8、fmicrosatelliteDNAintheseinsectswereanalyzed.【Result】Thepositiveclonerates,microsatelliterates,clo-ningeficiencyandredundancyratesofmicrosatelliteDNAamongthespecieswe

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