牛pparapparγ基因多态性及其与生长性状相关性分析

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1、牛PPARaPPARγ基因多态性及其与生长性状相关性分析第1章引言1.1中国地方黄牛牛品种介绍农业是支撑我国国民经济的基础产业，是我国的第一产业。畜牧业作为现代农业的重要组成部分，是衡量一个国家和地区现代化发展状况的重要标志⑴。改革幵放以来，特别是进入21世纪以来，随着人民生活水平的不断提高和社会经济的快速发展，人们对于动物蛋白的需求量日益增加，我国畜牧业急速发展，目前已成为我国农村经济发展中最具活力的支柱性产业。作为重要的动物蛋白，肉牛业必将成为极具潜力的朝阳产业[2]。黄牛是我国传统的役用畜，但随着农业机械化程度的不断提高，作为役用的牛逐步

2、向肉用转变。与其它肉类相比较，牛肉具有脂肪少、瘦肉多、蛋白含量高、胆固醇含量低、必需氨基酸含量均衡[3]，同时维生素和微量元素含量丰富，是人们生活理想的食品之一。随着人们对牛肉营养价值认识的深入，养牛也幵始向肉用方向转变，并已成为黄牛开发利用的主导方向。我国地方黄牛品种资源繁多、分布广泛，且品种之间差异较大，优势特征较为明显。例如，肉脂品质好、对农副产品词料具有良好的利用能力、繁殖能力强、适应性强和有害性状的遗传频率相对较低等优良特性。因此，我国地方黄牛品种成为我国乃至全世界牛繁殖育种的重要遗传资源[4]。然而，役用黄牛作为肉用品种进行规模化生

3、产，仍然存在很多缺陷。例如，生产性能低、生长慢、体型小、产肉量少、肉品质差及高档优质牛肉产量低等劣势，这些因素制约着我国肉牛业的发展。针对我国肉牛产业目前的发展状况，只有对黄牛生长性能和牛肉品质进行改良，培育出优良的肉牛品种才能满足现代社会对牛肉的需求，这也是我国肉牛产业化发展的重要出路[5]。动物的生长性状通常由多个基因共同控制，单个基因对某一性状的影响相对较小，并且基因与基因之间、基因与环境之间都可能存在多重互相影响，即复杂性状一般符合的微效多基因理论[6]。传统的育种方法对提高后代的生长发育性能有一定效果，但是受到多个基因共同控制的影响，

4、其选择效率低、准确性差、选择周期长，这些因素都会限制优质地方资源的育种进程。动物分子标记育种从分子水平上对影响动物生长性状和屠宰性状的遗传机理进行研究。选取对某性状有较大影响的基因作为候选基因，从分子水平来研究所选候选基因的单核苷酸多态性（Singlenucleotidepolymorphism,SNP)及其与生长发育的遗传调控规律，以此来寻找影响黄牛生长发育性能相关的分子遗传标记[7]。1.2分子遗传标记简介广义上，遗传标记可以理解成生物体内受基因控制的全部可变异的性状，并且这些性状可以通过有效的方法和手段进行测定或度量。根据遗传标记的本质和

5、检测方法的不同，遗传标记一般可分为形态学标记、生化标记、细胞学标记和分子标记。在这4类遗传标记中，分子遗传标记弥补了其他遗传标记数目少、多型性不丰富等方面的不足，是目前使用最多、应用范围最广的一类有效标记。分子遗传标记是根据基因组存在的丰富多型性而发展起来，它是一类在DNA水平上直接反映生物个体差异的遗传标记。这种DNA水平上的差异是由于构成DNA分子的碱基或核苦酸序列发生缺失、插入、重复、易位、倒位或重排等一系列原因引起的，从而产生的多型现象。目前，分子遗传标记技术已有数十种，常用的有单核苷酸多态性（Singlenucleotidepolym

6、orphism,SNP)、限制性片段长度多态性（Restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)、随机扩增多态性DNA(RandomamplifiedpolymorphicDNA，RAPD)、扩增片段长度多态性（Amplifiedfragmentlengthpolymorphism，AFLP)、微卫星DNA标记（Simplesequencerepeat，SSR)等分子遗传标记。第2章材料与方法2.1实验材料本研究所使用的DNA样品分别提取于5个中国地方黄牛品种和一个高原牦牛群体，包括郏县红牛、南阳牛、鲁西牛

7、、秦川牛和勸海黑牛在内共计514头（见表2-1)。每头牛采集适量颈静脉血样并按照按照抗凝剂与血样1：6的比例加入适量抗凝剂，超低温保存备用。在釆集牛血样时同时测定并记录其生长数据，主要包括体高（BH)、体斜长(BL)、胸围（CC)、腹围（AC)、腰角宽（HBJly基因SNPs检测及其与牛生长性状..........443.3.1牛PMy基因突变区域的PCR扩增..........443.3.2牛PE4Ry基因三个多态位点PCR-RFLP分析..........463.3.3牛基因三个多态位点的群体遗传学分析..........483.3.4牛基

8、因三个位点多态性与牛经济性状关联分析..........513.3.5牛基因三个多态位点的连锁不平衡..........573.3.6讨论......