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《脊髓性肌萎缩症SMN基因拷贝数定量分析.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、中华医学遗传学杂志2004年4月第21卷第2期ChinJMedGenet,April2004,Vol.21,No.2·153··论著·脊髓性肌萎缩症SMN基因拷贝数定量分析丁华新杨晓苏肖波吴志国张丽芳【摘要】目的探讨临床诊断为脊髓性肌萎缩症(spinalmuscularatrophy,SMA)而PCR定性无运动神经元生存(survivalmotorneuron,SMN)基因T拷贝(SMN-T)缺失患者的遗传基础;并探索SMA表型与SMN基因C(SMN-C)拷贝数的关系及SMA患者及其直系亲属和正常人SMN基因拷贝数的分布。方法对临床和病理
2、诊断为SMAⅠ～Ⅳ型及少见型45例患者、25名表型正常的SMA直系亲属进行SMN-T和SMN-C基因拷贝数定量分析,并与33名正常人进行对比;所有对象均已经PCRDraⅠ酶切法定性检测SMN基因,其中Ⅰ～Ⅱ型的7例和Ⅲ型的2例为SMN-T纯合缺失,余者无缺失。建立SMN-T和囊性纤维化跨膜调节因子(cysticfibrosistransmembraneconductanceregulator,CFTR)的内标,所有标本进行非放射性、非荧光标记的多重竞争性PCR,根据产物SMN-T/CFTR和SMN-C/CFTR比值,计算SMN-T和SMN
3、-C拷贝数。结果7例Ⅰ～Ⅱ型SMN-T拷贝数均为0;Ⅲ型2例拷贝数为0,2例为1个拷贝数,系杂合缺失,4例为2个拷贝;Ⅳ型及其他型患者均为2个拷贝;直系亲属中9例为1个拷贝,系杂合缺失,其余及正常对照组均为2个拷贝。SMN-C拷贝数在SMAⅠ型为≤2,Ⅱ～Ⅲ型为≤3,Ⅳ型及其它型SMA、直系亲属和正常对照组均为0～3。结论PCR定量检测SMN-T拷贝数为0者与定性检测的纯合缺失相符,定量检测还可发现杂合缺失患者及携带者;SMA患者的表型与SMN-C拷贝数有关,拷贝数越少,表型越重;SMAⅣ型及少见型患者的SMN基因拷贝数正常,支持其发病与
4、SMN基因无关。【关键词】脊髓性肌萎缩症;运动神经元生存基因;基因拷贝数*QuantitativeanalysisofSMNgenecopiesinspinalmuscularatrophyDINGHua-xing,YANGXiao-su,XIAOBo,WUZhi-guo,ZHANGLi-fang.(DepartmentofNeurology,XiangyaHospital,CentralSouthUniversity,Changsha,Hunan,410008P.R.China.Email:neurogxm@public.cs.hn.c
5、n)Correspondingauthor:YANGXiao-su【Abstract】ObjectiveTostudythegeneticbasisinthepatientswithclinicaldiagnosisofspinalmuscularatrophy(SMA)butwithoutsurvivalmotorneurontelomericcopy(SMN-T)deletion;therela-tionshipbetweentheSMN-C(centromeric)copiesandthephenotype;andthedistri
6、butionofSMN-CandSMN-TcopiesintheSMApatients,thecarriersandthecontrols.MethodsQuantitativePCRanalysisofSMN-TandSMN-Ccopieswerecarriedoutin45patients,25consanguineousand33controlindividuals.Thepatientswereidentifiedbyclinicalmanifestationandmuscularpathology.Twointernalstan
7、dardsofSMN-Tandcysticfibrosistransmembraneconductanceregulator(CFTR)wereconstructed.Nonradioac-tiveandnonfluorescence-labelingcompetitivePCRwereused.ThenumbersofSMN-TandSMN-CcopiesweredeterminedbycalculatingtheratiosofSMN-T/CFTRandSMN-C/CFTR.ResultsQuantitationofSMN-Tgene
8、copiesinSMApatientsrevealedthatninecasesoftypeⅠ-Ⅲwerehomozygouslydeleted.TwocasesoftypeⅢhadonlyo
