应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性

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1、维普资讯http://www.cqvip.com动物学研究2005，Dec．26(6)：595—602CN53—-1040／QISSN0254—-5853ZoologicalResearch应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性全迎春2，孙效文1．，梁利群1(1．黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室，黑龙江哈尔滨150070；2．上海水产大学生命科学与技术学院，上海200090)摘要：选择12个斑马鱼功能基因的微卫星标记和12个鲤鱼微卫星标记，检测黑龙江鲤(Cypinc。幻haematopterusTemmincketSchlege1)、散鳞镜鲤(C．carpi

2、o)、荷包红鲤抗寒品系(C．cⅡrpiovar．uyuanensis)、松浦鲤(C．carpioSongpucarp)的群体遗传多样性：共检测到3882个扩增片段，长度为126～489bp，在群体间扩增出1—5个等位基因不等，共计59个等位基因，平均等位基因2．46个。数据经PHYLIPV3．6软件估算和MEGA3软件作图，确立4个群体问的亲缘关系。并应用Bootstrap检验估计系统树中节点的自引导值，并进行了系统发生分析。结果表明：①4个群体检测的有效等位基因数都在55个以上，平均观测杂合度为0．36～0．43，平均期望杂合度为0．49～0．53，平均多态信息含量为0．210

3、．25，说明这几个群体多态性属于中度偏高水平，遗传多样性较高；②群体间相似系数都在0．84以上，遗传距离较近，为0．067～0．170，与前人研究结果一致。聚类分析显示，松浦鲤与散鳞镜鲤亲缘关系最近，荷包红鲤抗寒品系与它们的亲缘关系较黑龙江鲤更近；③在3个斑马鱼功能基因相关的微卫星位点上，黑龙江鲤缺失特异扩增条带，这可能与几种鱼类的育成史关键词：鲤鱼；微卫星；群体多样性；分子标记中图分类号：Q959468文献标识码：A文章编号：0254—5853(2005)06—0595—08MicrosatelliteVariationAmongFourBreedingPopulationso

4、fCommonCarpsQUANYing—chun，，SUNXiao—wen，，LIANGLi—qunf1．HeilongjiangFisheriesResearchInstitute，ChineseAcadem)ofFisheryScience，Harbin150070．ChinⅡ2．CollegeofAqua—ScienceandTechnolog)，，ShanghaiFisheriesUniversity，Shanghai200090，Chinn』Abstract：Usingmicrosatellitemarkerswedeterminedpolymorphismofgen

5、omicDNAandclassificationinfourim—portantcultivationspecies：Commoncarp(C)prinuscarpiohaematopterusTemmincketSchlege1)，Scatterscaledmirrorcarp(Ccarpio)，Frigid—resistantstrainofPurseredcarp(Ccarpiovarwuyuanensis)andSongpucarp(CcⅡrpioSongpucarp)Amplificationswith24pairsofprimersgaveatotalof3882fr

6、agmentsrangingfrom126bpto489bDinthe4populations，whichincluded12pairsofmicrosatellitesdesignedaccordingtozebrafishfunctiongenesequencesand12pairsofmicrosatellitesisolatedfromcommoncarp1—5allelesperlocusin4specieswereamplified．andtherewere59allelesinallpopulationsexceptcommoncarpwhichhadonly21l

7、ociand55allelesTheaveragenumberofalleleswas2．46Additionally，aclusteringanalysiswasmadebasedontheresultsofthePHYLIPsoflwarepackage(version3．6)andphylogenetictreeswereconstructedbyMEGA3Thebootstrapvalueswereevaluatedforeachcn1nodeofthedendro—gr