水稻抗黑条矮缩病相关mirna鉴定及功能分析

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2、.寅水稻抗黒条矮缩病相关miRNA鉴定及功--A/’’J一A':.心*户^■冷广■■研究生:古姻fe舞巧,拾导教师周益笔.递援__茜貧4勢'<接^;秦单:检:#生論科学学院写:奮.戰―'.'".■.甲\:.三:..沪';.户"",專象学科:>生物学,?篆二级学科:术.^完成时巧、215年4月20百X/;■、—■,..■^"'2015年5巧巧日;.答辩时间''■....^.:..,,y:1-

3、■,,一.■-;:',、A—Vi.广■学位论文独创性声明本人郑重声明:所提交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作和取得的研究成果。本论文中除引文外、,所有实验数据和有关材料均是真实的。本论文中除引文和致谢的内容外,不包含其他人或其它机构已经发表或撰写过的研究成果。其他同志对本研究所做的贡献均已在论文中作了声明并表示了谢意。学位论文作者签名:秦堆]義日期:劝S^学位论文使用授权声明研究生在校攻读学位期间论文王作的知识产权单位属南京师范大学。学校有权保存本学位论文的电子和纸质

4、文档,可W借阅或上网公布本学位论文的部分或全部内容,可W采用影印、复印等手段保存、汇编本学位论文。学校可W向国家有关机关或机构送交论文的电子和纸质文档,允许论文被查阅和借阅。(保密论文在解密后遵守此规定)保密论文注释:本学位论文属于保密论文:,密级保密期限为。年:麥学位论文作者签名指导教师签名;曰期:孤9乂日期:碟;乂,A摘要水稻黑条矮缩病(RBSDV)是近年来我国华东稻区最为严重的水稻病毒病害,严重影响水稻产量的提高。利用植物自身抗性培育抗性品种是防治该病毒病的根本策略。

5、RNA沉默机制是植物抵御病毒侵染的重要途径,miRNA是其中关键性的负调控因子,生,广泛调控植物基因表达长发育和逆境胁迫响应等各个生物途径。本研究在筛选出的抗感RBSDV水稻品种的基础上构建小RNA文库,并通过高通量测序和生物信息学分析获取在抗病和感病品种中胁迫相关水稻mmiRNA在水稻iRNA,并通过对郎基因的预测和功能分析阐述接种病毒后对植株的生长发育W及抗病相关途径的影响。本研究通过人工接种鉴定方法鉴定90个水稻品种得到了相对抗病品种9311和感病品种日本晴,并W此为材料构建侵染前后抗感品种的茎巧及叶片小RN

6、A文库共8个。利用商通量测序与生物信息学分析筛选得到很多与水稻黑条矮缩病胁迫相关miRNA,结合Northern杂交、焚光定量等方法对部分miRNA及其範基因进行表达检测分析,得到主要结果如下:?1.8个文库获得的小RNA序列总数在47958335697879之间,其中与水稻30-基因组匹祀数在.48%45.97%之间。水稻黑条矮缩病胁迫后,样本间miRNA差异表达茎杆和叶片全部下调的数目为38个,全部上调的数目为12个;%11上调Nip下调的数目为31个,9311下调Nip上调的数目为1个,叶片上调茎杆下调

7、的数目为9个,叶片下调茎巧上调的数目为18个。2.在表达显著的miRNA中挑出14个差异表法显著的miRNA,送些miRNA分别隶属于14个miRNA家族。通过Northern杂交验证试验,得到miRl%和miR168的杂交条带,其中%11叶片在胁迫后miRlW的表达量明显増加,茎轩在胁迫后mi民156的表达量増加,日本晴叶片在胁迫后miR156的表达量明显减少,茎杆在胁迫后miRK6的表达量増加。而iniR168在胁迫后叶片和茎巧表达量没有发生明显变化。3.对14个表达丰度高的miRNA中的13个miRNA所预测

8、到的18个飽基因RT-PCR分析进行q,结果挑选了9个表达水平大致与对应miRNA呈现相对应的负调控变化的祀基因。对这些miRNA进行分析发现,miR16

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