微卫星标记及其在鱼类原种检测中的应用

《微卫星标记及其在鱼类原种检测中的应用》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、第29卷第9期水产科学Vol_29NO．92010年9月FISHERIESSCIENCESep．2010微卫星标记及其在鱼类原种检测中的应用梅秋兰1,2，刘臻，曾国清。，张学文，鲁双庆(1．长沙学院生物工程与环境科学系，湖南长沙410003；2．湖南农业大学生物科学技术学院，湖南长沙410128；3．湖南省鳜鱼原种场，湖南长沙4i0oo)关键词：微卫星标记；原种检测；鱼类中图分类号：Q_336文献标识码：C文章编号：1003一llll(2010)09—0563—04我国拥有多达3000余种鱼类，其中淡水鱼类AAAA、CA、

2、GT、CAG等，常见的微卫星有TGTG有800多种，分属于13目38科226属L1]。此外，近⋯⋯TG一(TG)n或AATAAT⋯⋯AAT一3O多年来，从国外引进的鱼类约有40多种。这些(AAT)n等。重复单位的拷贝数决定微卫星的长物种无论在形态方面，还是在生物学特性、栖息环度，是高度多态的遗传标记。境方面，多样性都极其丰富。但随着人工养殖规模根据重复单元的构成与分布，微卫星DNA序得逐渐扩大，鱼类原种受水体污染、自然生态环境列被分为3种类型：单一型(Pure)，复合型(Corn—破坏和水利工程等因素的影响，导致鱼类原种种

3、质pound)和间断型(Interrupted)，微卫星标记由核心资源逐渐退化[2]。因此，开展鱼类原种保存对提高序列及两侧保守的侧翼序列构成。核心序列重复养殖产量有着十分重要的意义。数的差异形成微卫星的高度多态性，保守的侧翼序微卫星(Microsatellite，MS)又称简单重复序列则使微卫星特异地定位于染色体某一区域。一列(Simplesequencerepeat，SSRs)，广泛分布于真般认为，微卫星的基本构成单位多位于编码区附核生物基因组中[3]。利用微卫星标记对鱼类展开近，也可位于内含子、启动子及Alu序列中[

4、1。研究始于2O世纪9O年代初_4]。因其数量多、多2微卫星的特点态性强、片段小等优势，该技术在动植物种群遗传微卫星具有多态性高、按照孟德尔方式分离、结构分析、多样性检测、构建遗传图谱及数量性状呈共显性遗传、在数量方面没有生物学上的限制、基因定位分析与克隆、遗传育种等研究中应用广试验程序简单等优点[1。泛。笔者就微卫星标记在鱼类原种检测中的应(1)数量丰富微卫星数量多且均匀分布在基用进行综述，以期对鱼类种质资源保护提供理论依因组中，约占真核基因组的5D83。通常认为重复据。序列的产生是由于在遗传物质复制过程中DNA滑l微卫

5、星概念动或在有丝分裂、减数分裂期染色体不对等交换所1974年Skinner等[1在寄居蟹(Clibanarius)致，因此该重复序列多发现于不经严格选择的基因的基因组中发现了含TAGG重复单位的简单重复组区域。据估计，基因组中平均3O～5Okb就存序列，随后又在人、动物及酵母的基因组中发现了在一个微卫星，极大的方便了在整个基因组中定位大量简单小单位的重复序列。1989年Litt等[1扩更多的基因。增出了人类微卫星序列，并命名为“微卫星”。Ta—(2)多态性高微卫星具有丰富的多态性，主ntz等[3]的研究表明微卫星DNA广泛

6、随机地分布要表现在核苷酸重复单位数目的变异和重复序列于真核生物的基因组中，包括编码区和非编码区。中核苷酸的替换。在基因组中，因微卫星每个序列微卫星是指基因组中2～5个核苷酸重复序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大，从为单位串联组成的长达几十个核苷酸的序列。而形成其座位的多态性。这些改变也可以引起相一般认为其重复单位有AG、TA、AAA、CATT、当高的多态性，但突变率不高，在家系中可以稳定收稿日期：2009—12-10；修回日期：2009—01—28．基金项目：湖南省教育厅优秀青年项目(o9BOl1)；湖南省教育厅

7、重点项目(08A007)．作者简介：梅秋兰(1984一)，女，硕士研究生，研究方向：细胞生物学；E-mail：hnmqlan@163．corn．通讯作者：鲁双庆(1963一)，男，教授，博士，研究方向：生物技术与鱼类遗传育种；E—mail：lshqlzh@163．COrn．水产科学第29卷地遗传，是一种很好的遗传标志。研究表明，可能传多样性。并由UPGMA聚类图判定他们之间亲是DNA复制过程中的“链滑”(Strandslippage)现缘关系的远近，为青海湖裸鲤种群的遗传结构特象造成微卫星DNA多态性信息容量(Polymo

8、rphic征、种群历史及遗传资源的保护提供相关信息和依informationcontent，PIC)较高。据。于飞等[2用8个微卫星标记对大菱鲆(3)分析简单微卫星检测容易、重复性较(Scophthalmusmaximus)7个人工选育家系的137好、省时，适合进行自动化分析。通过GeneScan检个子