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《马氏珠母贝stardl3基因的克隆与表达性分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、马氏珠母贝STARDL3基因的克隆与表达性分析雷超郑哲王庆恒黄荣莲邓岳文杜晓东广东海洋大学水产学院广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝STARDL3基因cDNA全长序列(Pm-STARDL3);利用荧光定量技术检测Pm-STARDL3基因在各个组织中的表达量。结果表明,Pm-STARDL3基因cDNA序列全长3655bp,开放阅读框(ORF)长1491bp,编码496个氨基酸,5’非翻译区(5’UTR)长110bp,3’UTR长2054bp。PmSTARDL3氨基酸序列同源比对分析显示与华贵类捞孔扇贝(M
2、imachlamysnobilis)STARDL3的序列的相似度最高。SMART软件分析得出,Pm_STARDL3有STARD类蛋白特有的结构域。荧光定量PCR检测结果表明Pm-STARDL3在肝胰腺中表达量最高,其后依次是外套膜、鳃与闭壳肌,各组织的表达量差异具统计学意义(p<0.05)。关键词:马氏珠母贝;STARDL3;基因兗隆;基因表达;邓岳文,dengyw@gdou.edu.cn基金:国家自然基金“马氏珠母贝生长性状QTLs精细定位与相关基因功能分析(31372526)”CloneandExpressionAnalysisofS
3、TARDL3GenefromPinctadafucatamartensiiLeiChaoZhengZheWangQinghengHuangRonglianDengYuewenDuXiaodongFisheriesCollege,GuangdongOceanUniversity;Abstract:Tnthisstudy,thefulllengthofPm-STARDL3wasobtainedbyusingRACEtechnology.Theexpressionoftissue-specificwasdetectedbyReal-time1)
4、CR.Theresultsshowedthatthetotallengthofl)m-STARDL3genewas3655bp,including1491bpoftheopenreadingframe(ORF)thatencoded496aminoacids,a5’UTRof110bpanda3’UTRof2054bp.MultiplesequencealignmentindicatedthatPm-STARDL3washighidentitywithMimachlamysnobilis.Proteinsequenceanalysissh
5、owedthatPm-STARDL3hasatypicalSTARTstructuraldomain.FluorescencequantitativePCRanalysisshowedthatthehepatopancreashadthehighestexpressionofPm_STARDL3gene,followedbymantle,gillandadductormuscle,andtheexpressiondifferenceoftheorganizationhadstatisticalsignificance.Keyword:Pi
6、nctadafucatamartensii;STARTDL3;Genecloning;Geneexpression;stAR相关脂质转运蛋白-3类似蛋白(stAR-relatedlipidtransferprotein3-likeprotein,STARDL3)属于类固醇急性调节蛋白(steroidogenacuteregulatoryStAR)家族。它与STARD3(stAR-relatedlipidtransferprotein3)有很高的同源性,都有START结构域,此结构域是STARD类蛋Q的特有结构域(邢晋祎等,2015),能结
7、合多个疏水配体并经常出现在多结构域蛋白中,起到调节其它功能结构域的作用(Rodericketal.,2002),因而参与众多的生理过程。目前己知STARD3参与肭固醇、类固醇和脂类的物质的合成以及代谢过程(裘越,2013)。例如,人类视网膜STARD3是类胡萝卜素结合蛋闩,其作用是特异性结合叶黄素(Horvathetal.,2016),其功能位点是在C-端第216〜444位氨基酸上的START结构域。STARDL3作为StAR家族的成员之一,与STARD3有和同的功能结构域,也参与脂类物质的代谢(Wilhelmetal.,2016),0前
8、还未见有W类STARDL3基因功能的研宄报道。马氏珠母贝(Pinctadafucatamartensii)又称合浦珠母贝(Panctudufucutu)是我国南方重要的海水育珠贝,主要生产有核